مقایسه الگوی بیان ژن های دو ژنوتیپ حساس و متحمل به شوری برنج با استفاده از داده های میکرواری

شوری یکی از چالش های در حال گسترش برای تولید گیاهان زراعی است . تنش شوری سبب تغییر الگوی بیان بسیاری از ژن های درگیر در مسیرهای بیوشیمیایی مختلف می شود . این پژوهش به منظور بررسی تغییرات الگوی بیان ژنها در شرایط تنش شوری در برگ ژنوتیپهای خساس و متحمل به شوری برنج انجام شد. داده های بیکرواری در دو شرایط کنترل و تنش شوری از پایگاه داده NCBI گرفته شدند . نتایج نشان داده که به ترتیب 2314 و 1489 ژن پس از تنش شوری د ربرگ ژنوتیپ های حساس و متحمل تغییر بیان معنی داری داشتند . از این تداد بیان 750 ژن در نوتیپ حساس و 226 ژن در ژنوتیپ متحمل افزایش معنی داری نشان دادند . دیاگرام ون نشان داد که 71 ژن دارای افزایش بیان و 455 ژن دارای کاهش بیان بین دوژنوتیپ مشترک بودند . گروه بندی کارکردهای ژن های دارای افزایش بیان در دو ژنوتیپ مشخص کرد که در ژنوتیپ متحمل به شوری گروه های کارکردی پیام رسانی، پروتئینهای ذخره های و پاسخ به تنش دارای بیشترین تعداد ژن ها بودند در حالیکه در ژنوتیپ حساس به شوری، گروه های کارکردی metal-binding و اکسیدوریداکتاز ژن های بیشتری در خود جای دادند .

کلیدواژه ها:

برنج ، تنش شوری ، میکرواری