بهینه سازی ردیابی مولکولی باکتری عامل گرینینگ مرکبات

بیماری میوه سبز (گرینینگ) مرکبات خطرناک ترین بیماری مرکبات در دنیا محسوب میشود که از حدود پنج سال پیش از ایران گزارش شده و در حال حاضر در استان های جنوبی کشور شامل هرمزگان، سیستان و بلوچستان ،جنوب کرمان و کرمان گسترش دارد. علایم این بیماری با بسیاری از کمبودها و بیش بودهای غذایی و برخی از بیماری ها مشابه بوده و لذا تشخیص قطعی آن براساس علایم ظاهری امکان پذیر نیست. ردبابی عامل بیماری در درختان مرکبات در حال حاضر صرفا بر اساس روش های مولکولی مبتنی بر اسیدنوکلئیک و انجام واکنش زنجیره ای پلیمراز انجام می گیرد. آغازگرهای متعددی جهت ردیابی مولکولی عامل بیماری گرینینگ در درختان مرکبات معرفی شده که از دقت متفاوتی برخوردار هستند. در این تحقیق کارایی دو روش استخراج دی ان ای از رگبرگ درختان مرکبات از نظر کمیت و کیفیت دی ان ای استحصالی مورد مقایسه قرار گرفت. همچنین کارایی و دقت سه جفت آغازگر اختصاصی باکتری عامل گرینینگ در واکنش زنجیره ای پلیمراز مقایسه شد. براساس نتایج بدست آمده روش تغییر یافته استخراج دی ان ای مبتنی بر CTAB (Zhang et al., 2000) و استفاده از جفت آغازگر fp400/rp400 که قطعه ای از نواحی ژنی NusG و (rplK) 50s ribosomal protein L 11 باکتری عامل بیماری به طول 400 جفت باز را تکثیر می کند، مناسبترین روش جهت ردیابی مولکولی باکتری مذکور معرفی می شود.

کلیدواژه ها:

استخراج دی ان ای ، ردیابی ، گرینینگ ، مرکبات