پایگاه های داده های پروتیینی و کاربرد آن ها در بیوتکنولوژی کشاورزی

افزایش روز افزون داد ههای پروتیینی موجب پیدایش پایگا ههای بزرگ برای ذخیره، طبق هبندی و بازیابی اطلاعات شده است. این پایگا هها با اصول و سیاست های گهگاه متفاوت به تدریج دامنه ی ابزارها و زیرمجموع ههای خود را گسترش داد هاند. در این مقاله به معرفی و بررسی چارچوب کارکرد کلی این مجموعه ها حول محورهای توالی، ساختار سه بعدی، عملکرد، مقایسه توالی ها ، تغییرات پروتیی نها در روند تکامل و یا اتصال به لیگاند پرداخته و در ادامه ابزارها و امکانات این پایگا هها با یکدیگر مقایسه می شوند. تمرکز اصلی بر روی زیرمجموع ههای دو بانک اطلاعات پروتیینی (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein) و NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/cdd مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی ایالات متحده و (http://www.ebi.ac.uk/Databases/protein.html) EBIموسسه ی بیوانفورماتیک اروپا که در بردارنده ی صفحات Swiss-Prot است می باشد. همچنین به دو پایگاه InterEvol و PSCDB که به ترتیب به ساختار و تکامل کمپلکس های پروتیینی و تغییرات ساختار پروتیین در اتصال به لیگاند اختصاص دارد اشاره می شود.

کلیدواژه ها:

بیوانفورماتیک ، پایگاه های داد ههای پروتیینی ، ، Swiss-Prot ، پیش بینی عملکرد پروتیین