ره یافت بیشینه ی درست نماییmaximum likelihood در فیلوژنتیک

سال انتشار: 1396
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 458

فایل این مقاله در 7 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

AGRIHAMAYESH01_027

تاریخ نمایه سازی: 17 آبان 1396

چکیده مقاله:

درختان فیلوژنتیکی روابط خویشاوندی را بین موجودات مختلف به صو رت گرافیکی نشان میدهند. روشهای مختلفی برای رسم تبارنماها وجود دارد که برخی از آنها از معیارهای بهینگی برای انتخاب بهترین تبارنما در بین مجموعهی تبارنماهای رسم شده استفاده میکنند. یکی از این معیارهای بهینگی، بیشینهی درست نمایی است.سه جزاصلی رهیافت بیشینه ی درست نمایی شامل داده مدلی برای توصیف احتمال مشاهده ی داده و معیاربیشینه ی درست نمایی است. در این روش، تبارنمایی که بیشترین احتمال وقوع را داشته است از میان مجموعهی تبارنماهای رسم شده انتخاب میشود مزیت بزرگ استفاده ازرهیافت بیشینه ی درست نمایی در رسم درختان فیلوژنتیکی، قابل اعتماد بودن نتایج حاصل از آن است، اما علیرغم کارایی استفاده از این رهیافت در واکاویهای فیلوژنتیکی، بزرگترین مشکل استفاده از ره یافت بیشینه ی درست نمایی محاسبات پیچیده و وقت گیر آن است. به همین دلیل گاهی به جای بیشینهی درست نمایی ازسایرره یافت ها مثل بیشینه ی پارسمونی استفاده می .شود

کلیدواژه ها:

تبارنما ، معیار بهینگی ، بیشینه ی درست نمایی

نویسندگان

بنفشه رضایی مطلق

استادیار، بخش تحقیقات گیاهپزشکی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان فارس، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، شیراز

رضا مستوفی زاده قلمفرسا

استاد، بخش گیاهپزشکی، دانشگاه شیراز

آزاده حبیبی

استادیار، گروه تنوع زیستی، پژوهشگاه علوم و تکنولوژی پیشرفته و علوم محیطی، دانشگاه تحصیلات تکمیلی صنعتی و فناوری پیشرفته، کرمان