مقایسه ساختاری پروتیین NPR1 در گونه های مختلف گیاهی
سال انتشار: 1395
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 361
فایل این مقاله در 9 صفحه با فرمت PDF و WORD قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
AGROCONGRESS03_536
تاریخ نمایه سازی: 8 اردیبهشت 1396
چکیده مقاله:
پروتیین NPR1 در سیستم مقاومت اکتسابی گیاهان (SAR) نقش اساسی دارد. این پروتیین با اتصال به TGA (فاکتور رونویسی) باعث تظاهر ژن PR1 به عنوان ژن مقاومت می شود. این بررسی با هدف مقایسه ساختار این پروتیین در گونه های مختلف گیاهی صورت گرفت. جهت جمع آوری اطلاعات اولیه پروتیین NPR1 در گیاه آرابیدوپسیس از سایت TAIR استفاده شد. در آرابیدوپسیس این پروتیین دارای 593 اسیدآمینه است. برای آنالیز حوزه ها از سایت Expasy استفاده گردید. با روش BLASTp در سایت NCBI و Uniprot 20 پروتیین مشابه در سایر گونه ها انتخاب شده و تطابق چندتایی با نرم افزار T-Coffee صورت گرفت. ترسیم درخت فیلوژنی 20 گونه منتخب با نرم افزار Mega4 انجام شد. نتایج نشان داد که در حوزه BTB/POZ، گیاه ذرت دارای بیشترین اختلاف با سایر گونه ها بود. در سیستیین شماره 82 و 216 که در تشکیل اتصالات دی سولفیدی نقش دارند و سیستیین شماره 521 و 529 که در اتصال به یون فلزی اهمیت دارند، اختلافات اساسی بین گونه ها وجود داشت. رسم درخت فیلوژنی 4 گروه را در میان گونه ها آشکار ساخت که گیاه ذرت به تنهایی در یک گروه قرار گرفت.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
زین العابدین شهادتی مقدم
محقق گروه بیوتکنولوژی مرکز تحقیقات و آموزش تیرتاش (مازندران، بهشهر) و دانشجوی دکتری اصلاح نباتات دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :