ساخت کاست siRNA جهت کاهش بیان ژن های - γ پرولامین حاوی اپیتوپ های سلیاک

گلوتن مخلوطی از پرولامین ها حاوی گلیادین ها و گلوتنین ها در گندم و پروتیین های معادل آنها در جو (هوردیین) و چاودار (سکالین) است که 80 درصد کل پروتیین های غلات دانه ریز را به خود اختصاص می دهد.شواهد روشنی مبنی بر عدم امکان تحمل اپی توپ های غنی از پرولین و گلوتامین (پپتیدهای mer-9 ) حاصل از بیان ژن های -γ پرولامین غلات توسط افراد مبتلا به بیماری سلیاک وجود دارد. در حال حاضر،رژیم غذایی فاقد گلوتن به عنوان تنها راهکارموثردر درمان بیماری سلیاک شناخته می شود.از طرفی، شدت حساسیت در افراد مبتلا به بیماری سلیاک توسط فناوری تداخل (RNAi)RNA قابل کنترل است. بنابراین، هدف از این مطالعه ساختیک کاست القایی siRNA و bp 1190 اختصاصی برای هدف گیری موثر γ- پرولامین های Triticeae می باشد. در این تحقیق، یک استراتژی همسانه سازی نوین مبتنی بر توالی های تکراری مستقیم و معکوس bp 60 به همراه یک ناحیه فاصله دهنده برگرفته از قطعه مستقیم ˷175bp مابین دو توالی تکراری اتخاذ شده است. پروموتور γ- گلیادین آندوسپرم 890 bp با حداکثر میزان هم ردیفی در بالادست کاست hpRNA همسانه سازی گردید. نتایج هم ردیفی ارتباط بالایاین کاست را با 16 گونه Triticeae با حداکثر میزان همولوژی 98 %~ نشان میدهد. جهت دستیابی به توالی تکراری مستقیم و معکوس کارآمد، 4 جایگاه siRNA مستعد پوشش دهنده کامل اپی توپ های متداول گلیادین در مجاورت یکدیگر به روش بیوانفورماتیکی شناسایی گردید. با توجه به نتایج آنالیز بیوانفورماتیکی، این کاست قابلیت هدف گیری موثر mRNA های -γ پرولامین های Triticeae را دارا می باشد.

کلیدواژه ها:

اپی توپ های بیماری سلیاک ، تداخل RNA ، کاست القایی siRNA ، گاما -پرولامین ها ، غلات دانه ریز