آنالیز بیوانفورماتیکی پروتیین VP35 ویروس ابولا ebola

ویروس ابولا یکی از کشنده ترین ویروس هایی است که تا کنون شناخته شده است و باعث بیماری شدید در انسان و نخستی ها می شود یک جز حیاتی در مسیر بیماری زایی ویروس ابولا پروتیین VP35 می باشد. پروتیین مزبور با مقاومت طبیعی سلول های میزبان در برابر عفونت های ویروسی تداخل میکند و این امر در واقع عامل گسترش عفونت در بدن می شود. در این مطالعه توالی پروتیین مربوطه از پایگاه اطلاعاتی NCBI و ساختار سه بعدی آن از پایگاه PDB استخراج شد. به کمک سایت Prot Param درصد آمینواسیدهای تشکیل دهنده و شاخص هیدروفوبیسیته پروتیین تعیین شد. از سایت Compute pl/Mw برای بدست آوردن وزن مولکولی و نقطه ایزوالکتریک پروتیین استفاده گردید. برای شناسایی تغییرات پس از ترجم های پروتیین از سایت های PeptideMass و Find Mod استفاده شد. در نهایت از نرم افزار Molegro Molecular Viewr برای آنالیز ساختار فضایی پروتیین استفاده گردید. از آنجا که عملکرد پروتیین به شدت وابسته به ساختار فضایی پروتیین است این موضوع می تواند چشم انداز جدیدی در درمان بیماری ها باشد تا جایی که امروزه استفاده از اطلاعات مربوط به ساختار سوم پروتیین ها از روش های اساسی در طراحی منطقی داروها به شمار می رود.

کلیدواژه ها:

ویروس ابولا ، پروتیینVP35 ، پایگاه اطلاعاتی NCBI ، ساختار سوم پروتیین ها