مدل سازی پروتئین CALBINDIN D9k با نرم افزار SWISS MODEl

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,148

فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

BSCONF01_675

تاریخ نمایه سازی: 15 بهمن 1393

چکیده مقاله:

پروتئین calbindin-D9k که توسط ژن S100G رمز می شود، متعلق به خانواده پروتئین های متصل شونده به کلسیم است. اعضای این خانواده پروتئینی علاوه بر این پروتئین شامل کالمودولین، پاروآلبومین و تروپونین C می باشند. در انسان تمام پروتئین های متعلق به این خانواده به جز پروتئین calbindin-D9K تعیین ساختار شده اند. این پروتئین وابسته به ویتامین D بوده و در سلولهای روده، غضروف و استخوان، دندانها و در گونه هایی از پستانداران در کبد و رحم دیده شده است. در روده حضور آن جهت جذب کلسیم رژیم غذایی ضروری است. با توجه به نقش مهم این پروتئین، در این مقاله به تعیین ساختار آن با نرم افزار swiss model پرداخته شده است و سپس پارامترهایی مثل انرژی، تعداد پیوندهای هیدروژنی، میزان RMSD سطح در دسترس، پتانسیل الکتروستاتیک محاسبه شده، ساختار دوم پروتئین بررسی گردیده، نمودار راماچاندران ترسیم شده و در نهایت جهش هایی که منجر به تغییر ساختار در مدل ما می شوند مورد بررسی قرار گرفته است

نویسندگان

مریم سردابی

کارشناس ارشد بیوتکنولوژی میکروبی دانشگاه الزهرا

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Bareley N F, Prathalingam S R, Zhi P, Legon S, ...
  • Howard A, Legon S, Spurr NK and Walters JR. Molecular ...
  • Hwang I, Hong E J, Yang H, Hong-Seok Kang H ...
  • Hwang I, Yang H, Kang HS, Ahn C, Hong EJ, ...
  • Inpanbutr N, Emam M A, El-Zoghby I and BolonB Expression ...
  • Jeung EB, Leung PC and Krisinger J. The human calbindin ...
  • Kiyota Y and Takeda-Sh itaka M. Molecular Recognition Study on ...
  • Ko SH, Choi KC, Oh GT, Jeung EB: Effct of ...
  • Koo T H, Yang H, An B S, Choi K ...
  • Lee G S, Jung E M, Choi K C, Oh ...
  • Nguyen T H, Lee G S, Ji Y K, Choi ...
  • Project E, Nachliel E and Gutman M. Force fie ld-dependan ...
  • Sidler-Lauff K, Boos A, Kraenzlin M and Liesegang A. Influence ...
  • نمایش کامل مراجع