CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)
عنوان
مقاله

داکینگ مولکولی و آنالیز بیوانفورماتیکی جایگاه فعال آنزیم کلسترول اکسیداز

اعتبار موردنیاز PDF: ۰ | تعداد صفحات: ۴ | تعداد نمایش خلاصه: ۷۹ | نظرات: ۰
سال انتشار: ۱۳۹۶
کد COI مقاله: BSCONF05_023
زبان مقاله: فارسی
حجم فایل: ۲۶۹.۳۷ کیلوبایت
متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

راهنمای دانلود فایل کامل این مقاله

متن کامل این مقاله منتشر نشده و درپایگاه سیویلیکا موجود نمی باشد.

منبع مقالات سیویلیکا دبیرخانه کنفرانسها و مجلات می باشد. برخی از دبیرخانه ها اقدام به انتشار اصل مقاله نمی نمایند. به منظور تکمیل بانک مقالات موجود، چکیده این مقالات در سایت درج می شوند ولی به دلیل عدم انتشار اصل مقاله، امکان ارائه آن وجود ندارد.

خرید و دانلود فایل PDF مقاله

متن کامل (فول تکست) این مقاله منتشر نشده و یا در سایت موجود نیست و امکان خرید آن فراهم نمی باشد

مشخصات نویسندگان مقاله داکینگ مولکولی و آنالیز بیوانفورماتیکی جایگاه فعال آنزیم کلسترول اکسیداز

  رحمان مهدی زاده - آموزشکده فنی و حرفه ای سما، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد بندرعباس، ایران /مرکز تحقیقات پزشکی مولکولی،پژوهشکده سلامت هرمزگان، دانشگاه علوم پزشکی هرمزگان، بندرعباس، ایران
  سهیلا معین - مرکز تحقیقات پزشکی مولکولی،پژوهشکده سلامت هرمزگان، دانشگاه علوم پزشکی هرمزگان، بندرعباس، ایران/گروه بیوشیمی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی هرمزگان، بندرعباس، ایران
  مهدی یوسفی - آموزشکده فنی و حرفه ای سما، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد بندرعباس، ایران

چکیده مقاله:

زمینه و هدف: کلسترول اکسیداز آنزیمی است که اکسیداسیون کلسترول را همراه با احیای اکسیژن مولکولی به پراکسیدهیدروژن انجام می دهد . این آنزیم توسط برخی میکروارگانیسم های بیماریزا و غیر بیماریزا تولید می شود و ازمهمترین آنزیم های تجاری است که کاربردهای وسیعی در صنایع مختلف پیدا کرده است. هدف از این مطالعه مدل سازی ساختار سه بعدی پروتیین و شناخت اسیدهای آمینه ضروری درجایگاه فعال آنزیم توسط داکینگ مولکولی با هدف مهندسی آنزیم می باشد. روشها: ابتدا توالی نوکلیوتیدی و پروتیینی از پایگاههای اطلاعاتی GenBank و Uniprot استخراج شدند. جهت بررسی اولیه توالی ، از برنامه Blast استفاده شد و بهترین الگوی پروتیینی دارای ساختار PDB جهت ساخت مدل سه بعدی انتخاب شد. بررسی مناطق حفاظت شده بین توالی آنزیم مورد مطالعه و پروییینهای هم خانواده آن با رویهم اندازی چندگانه با استفاده از برنامه ClustalW و ESpript انجام شد. ساختار سه بعدی آنزیم توسط همولوژی مدلینگ با برنامه Modeller ساخته شده و پس از ارزیابی و ترسیم نقشه راماچاندران، با روش شبیه سازی داکینگ مولکولی با کمک نرم اقزار Arguslab دنباله های آمینواسیدی ضروری در جایگاه فعال شناسایی شدند. . نتایج: نتایج داکینگ مولکولی نشان داد که چهار دنباله آمینواسیدی شامل Lys-340، His-55، Tyr-270 و Ser-322 نقش مهمی در شناسایی و برهمکنش با سوبسترا داشتند. برهمکنشهای مهم در واکنش آنزیمی هیدروفوبی و هیدروژنی بودندو پس از ترسیم برهمکنشها و بررسی مناطق حفاظت شده، دنیاله Ser-322 بعنوان بهترین کاندید جهت آزمایشات جهش زایی انتخاب شد. بحث و نتیجه گیری: نتایج بدست آمده نشان داد که داکینگ مولکولی می تواند ابزار مناسیی در آنالیز جایگاه فعال آنزیم کلسترول اکسیداز بوده و به طراحی منطقی مهندسی آنزیم کمک نماید.

کلیدواژه‌ها:

کلسترول اکسیداز، داکینگ مولکولی، مهندسی آنزیم

کد مقاله/لینک ثابت به این مقاله

برای لینک دهی به این مقاله، می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت مقاله در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:
https://www.civilica.com/Paper-BSCONF05-BSCONF05_023.html
کد COI مقاله: BSCONF05_023

نحوه استناد به مقاله:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
مهدی زاده, رحمان؛ سهیلا معین و مهدی یوسفی، ۱۳۹۶، داکینگ مولکولی و آنالیز بیوانفورماتیکی جایگاه فعال آنزیم کلسترول اکسیداز، پنجمین کنگره ملی زیست شناسی و علوم طبیعی ایران، تهران، موسسه آموزش عالی مهر اروند و مرکز راهکارهای دستیابی به توسعه پایدار، https://www.civilica.com/Paper-BSCONF05-BSCONF05_023.html

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این مقاله اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (مهدی زاده, رحمان؛ سهیلا معین و مهدی یوسفی، ۱۳۹۶)
برای بار دوم به بعد: (مهدی زاده؛ معین و یوسفی، ۱۳۹۶)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

علم سنجی و رتبه بندی مقاله

مشخصات مرکز تولید کننده این مقاله به صورت زیر است:
نوع مرکز: دانشگاه آزاد
تعداد مقالات: ۲۳۱۲
در بخش علم سنجی پایگاه سیویلیکا می توانید رتبه بندی علمی مراکز دانشگاهی و پژوهشی کشور را بر اساس آمار مقالات نمایه شده مشاهده نمایید.

مدیریت اطلاعات پژوهشی

اطلاعات استنادی این مقاله را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

مقالات پیشنهادی مرتبط

مقالات مرتبط جدید

شبکه تبلیغات علمی کشور

به اشتراک گذاری این صفحه

اطلاعات بیشتر درباره COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.