ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

شناسایی بیوانفورماتیکی و بررسی تغییر بیان microRNA های کاندید پاسخ به تنش خشکی در برنج

محل انتشار: همایش ملی علوم و فنون کشاورزی
سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,129

فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/260370

شناسه ملی سند علمی:

CAST01_108

تاریخ نمایه سازی: 7 تیر 1393

چکیده مقاله:

(miRNA)MicroRNA ها نقش مهمی را در تنظیم بیان ژن‌ها در سطح پس از رونوشت‌برداری در گیاهان بازی می‌کنند. مطالعات اخیر نشان داده‌‌‌اند که miRNA ها، در بسیاری از فرایندهای مرتبط با تکثیر، رشد و نمود و پاسخ گیاه به تنش‌های زنده و غیرزنده نقش دارند. در این تحقیق ژن‌های هدف miRNA های برنج با استفاده از روش‌های بیوانفورماتیکی شناسایی و miRNA هایی که در کنترل ژن‌های دخیل در پاسخ به تنش خشکی نقش داشتند، مشخص شدند. سپس تغییر بیان برخی از این miRAN ها با استفاده از روش Qrt-PCR و آغازگرهای Stem-loop در شرایط تنش خشکی در مقایسه با شرایط عادی مورد بررسی قرار گرفت. miR444,mi3979,miR529 که به ترتیب در کنترل ژن‌های دخیل در انتقال پیام اکسین، فاکتورهای رونویسی SPL و فاکتورهای رونویسی MADS نقش دارند، کاهش بیان معنی‌داری را نشان دادند. کاهش بیان miR529,miR3979 می‌‌تواند متعاقباً باعث افزایش بیان ژن‌های فسفوریبوزیل ترانسفراز، BIG,BTBZI درگیر در مسیرهای پیام‌رسانی اکسین گردد. هم‌چنین کاهش بیان miR444,miR529 نیز می‌تواند به تغییر بیان برخی فاکتورهای رنویسی MADS,SPL که در بسیاری از فرایندهای اساسی گیاه مانند نمو نقش دارند، منجر گردد. بنابراین این miRNAها در برنج با کنترل مسیرهای پیام‌رسانی هورمون اکسین و تنظیم فاکتورهای رونویسی که خود مسئول تنظیم بسیاری از ژن‌های پاسخ به تنش هستند ، در شرایط تنش نقش خود را ایفا می‌کنند.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

احسان محسنی فرد

دانشجوی دکتری گروه بیوتکنولوژی و بهنژادی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد

محمد فارسی

استاد گروه بیوتکنولوژی و بهنژادی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد

امین میر شمسی کاخکی

استادیار گروه بیوتکنولوژی و بهنژادی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد

بهنام بخشی

دانشجوی دکتری گروه اصلاح نباتات، واحد علوم و تحقیقات تهران، دانشگاه آزاد اسلامی

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Archak, S. and J. Nagaraju (2007). _ Computational Prediction of ...
  • Arora, R., P. Agarwal, et al. (2007). "MADS-box gene family ...
  • Bartel, D. P. (2005). "MicroRNAs :genomics, biogenesis, mechanism, and function! ...
  • Chen, C., D. A. Ridzon, et al. (2005). "Real-time quantification ...
  • Ding, D., L. Zhang, et al. (2009). "Differential expression of ...
  • Ding, Y., Y. Tao, et al. (2013). "Emerging roles of ...
  • Ehya, F., A. Monavarfesh ani _ et al. (2013). 2 ...
  • Flynt, A. S. and E. C. Lai (2008). "Biological principles ...
  • Gil, P., E. Dewey, et al. (2001). "BIG: a calossin-like ...
  • Jung, J.-H., P. J. Seo, et al" .(20 09) .MicroRNA ...
  • Kantar, M., S. J. Lucas, et al. (2011). "miRNA expression ...
  • Khraiwesh, B.. J.-K. Zhu, et al. (2012). "Role of miRNAs ...
  • Kong, Y. M., A. A. Elling, et al. (2010). "Differential ...
  • Lee, Y., M. Kim, et al. (2004). "MicroRNA genes are ...
  • Li, T., H. Li, et al. (2011). "Identification and analysis ...
  • Li, W.-X, Y. Oono, et al. (2008). "The Arabidopsis NFYA5 ...
  • Liu, H.-H., X. Tian, et al. (2008). _ M icroarray-based ...
  • Lu, C., D.-H. Jeong, et al. (2008). "Genome-wide analysis for ...
  • Lu, W., J. Li, et al. (2011). "Expression pattern of ...
  • Luschnig, C. (2001). "Auxin transport: why plants like to think ...
  • Millner, P. A. (1995). "The auxin signal." Curr. _ CelLBiol. ...
  • Phillips, J. R., T. Dalmay, et al. (2007). "The role ...
  • Sun, G. (2012). "MicroRNAs and their diverse functions in plants." ...
  • Sunkar, R., V. Chinnusamy, et al. (2007). "Small RNAs as ...
  • Sunkar, R., X. Zhou, et al. (2008). "Identification of novel ...
  • Tardif, G., N. A. Kane, et al. (2007). "Interaction network ...
  • Trindade, I., C. Capitao, et al. (2010" .(miR398 and miR408 ...
  • Varkonyi -Gasic, E., R. Wu, et al. (2007). "Protocol: a ...
  • Vaucheret, H. (2008). "Plant Argonautes." TreudsLlaut Sci. 13(7): 350-358. ...
  • Wang, C., J. Han, et al. (2012). "Identification of microRNAs ...
  • Wang, Y., Z. Hu, et al. (2009). "Function annotation of ...
  • Wu, L., Q. Zhang, et al. (2009). "Rice MicroRNA effector ...
  • Xie, K , .C. Wu, et al. (2006). "Genomic organization, ...
  • Xue, L.-J., J.-J. Zhang, et al. (2009). _ C haracterization ...
  • Yamaguchi, T. and H.-Y. Hirano (2006). "Function and diversification of ...
  • Yoshida, S. D. A. Forno, et al. (1971). Iahoratorv manual ...
  • Zhou, L., Y. Liu, et al. (2010). "Genome-wide identification and ...
  • Zhu, Q.-H., A. Spriggs, et al. (2008). "A diverse set ...
    • نمایش کامل مراجع