انالیز مقایسه‌ای و فیلوژنتیکی miRNA ها در میان چهارگونه جو، پاپلوس، آرابیدوپسیس و سویا

سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 924

فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CAST01_123

تاریخ نمایه سازی: 7 تیر 1393

چکیده مقاله:

MiRNA ها، RNAهای تنظیم‌کننده کوچکی هستند که در فرایندهای مختلف بیولوژیکی ومتابلولیکی گیاه نقش دارند. در این تحقیق miRNA های بالغ و پیشساز در گیاهان تک لپه و دو لپه به منظور شناسایی miRNA های حافظت شده و هم‌چنین مشخص کردن تفاوت و شباهت‌های miRNA های بالغ و پیشساز در گیاهان مختلف مورد مقایسه قرار گرفته‌آند. تعداد 43 خانواده مشترک و 197 پیشساز miRNA مشترک بین تک لپه‌ای و دو لپه‌ای مشاهده شد. نتایج نشان داد که بیشترین حفاظت در دو منطقه از پیشساز است؛ یکی از آن‌ها در سمت 5P که معمولاً منطقه تولید کننده miRNA بالغ و منطقه دیگر در سمت 3P و معمولاً منطقه مکمل miRNA بالغ می‌باشد؛ اما سایر مناطق در بین این چهارگونه حفاظت نشده هستند.

نویسندگان

بهنام بخشی

دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات، گروه اصلاح نباتات، تهران، ایران

محمدرضا بی همتا

گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشگاه تهران، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، کرج، ایران.

احسان محسنی فرد

گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشگاه فردوسی، مشهد، ایران

مسعود توحید فر

بخش تحقیقات کشت بافت و انتقال ژن، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، کرج، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Fahlgren, N., S. Jogdeo, et al. (2010). "MicroRN A gene ...
  • Griffiths-Jones, S. R. J. Grocock, et al. (2006). "miRBase: microRNA ...
  • Khraiwesh, B., J.-K. Zhu, et al. (2012). "Role of miRNAs ...
  • Starega-Roslan, J., E. Koscianska, et al. (2011). "The role of ...
  • Starega-Roslan, J., J. Krol, et al. (2011). "Structural basis of ...
  • Sunkar, R. and J.-K. Zhu (2004). "Novel and stress-regulated microRNAs ...
  • Tamura, K., D. Peterson, et al. (2011). "MEGA5: molecular evolutionary ...
  • Vaucheret, H. (2008). "Plant argonautes." Trends igplantscience 13(7): 350-358. ...
  • Voinnet, O. (2009). "Origin, biogenesis, and activity of plant microRN ...
  • نمایش کامل مراجع