برهمکنش تاکاآمیلاز مهندسی شده وحشی و انواع کوتاه شده ان باقندهای هشت تا ده زیرواحدی مالتوز : مطالعه داکینگ

سال انتشار: 1395
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 583

فایل این مقاله در 8 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CHECONF03_016

تاریخ نمایه سازی: 14 آذر 1395

چکیده مقاله:

امروزه با گسترش تحقیقات بنیادی کاربرد تحقیقات در بستر این سیلیکو اهمیت بیشتری یافته است در این پژوهش با مهندسی انزیم در این سیلیکو به ترتیب 50 و 100 آمینه از –c به ترتیب برای تولید آمیل S1- امیل –S2 حذف شدند. برهمکنش ساختار وحشی آمیل C- و کوتاه شده تاکا آمیلاز با الیگوساکاریدهای هشت تا ده زیرواحدی مالتوز به وسیله برنامه های پرکاربرد در این زمینه بررسی شد که شامل اتوداک وینا و لیگپلات اسیدهای امینه هیدروفیل در جایگاه اتصال انزیم لیگاند نقش موثری دراند به همین خاطر با استفاده ازنرم افزار تحت وب پرات اسکیل از طریق بانک اطلاعت اکسپسی توالی آمیل C- از لحاظ هدیروفبیسته و هیدروفیلیسیته بررسی گردید سپس برا این منظور نتایج هر سه آنزیم توسط برنامه لیگپلات تعیین و با مقایسه امتیاز هیدروپاتی امینواسیدهای حاضر در جایگاه اتصال لیگاند با آنزیمهای با این تیجه استنباط شد که هرچه لیگاند طولتر می شود محلهای اتصال آن بر روی آنزیم هیدروفوب تر می گردد اگرچه آمیل SI نسبت به آمیل C و آمیل S2 با اتلاف یک واحدهای تمایل بیشتری به اتصال با مالتوهکتالوز دارد. با افزایش تعداد حلقه های گلوکزی لیگاند و حذف انتهای C ترمینال آنزیمهای مورد نظر اینگونه استنباط می گردد که محل اتصال آمیلازها با لیگاندهای طویل تر تحت تاثیر انتهای C ترمینال نیست.

نویسندگان

محمد اسلامی

گروه بیوشیمی واحدعلوم پایه دانشگاه آزاد اسلامی دامغان ایران

محمدرضا بزرگمهر

گروه شیمی واحدعلوم پایه دانشگاه آزاد اسلامی دامغان ایران

حمید هاشمی مقدم

گروه شیمی واحدعلوم پایه دانشگاه آزاد اسلامی دامغان ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Tester, R., X. Qi, and J. Karkalas, Hydrolysis of native ...
  • Kuriki, T. and T. Imanaka, The concept of the o-amylase ...
  • Kauzmann, W., Some factors in the interpretation of protein denaturation. ...
  • Davies, D.R., A correlation between amino acid composition and protein ...
  • Pace, C. and J. Hermans, The stability of globular protein. ...
  • Housaindokht, M.R., et al., Structural properties of the truncated and ...
  • Irwin, J.J. and B.K. Shoichet, ZINC-a free database of commercially ...
  • Morris, G.M., et al., AutoDock4 and A u toDockTools4 Autonated ...
  • Trott, O. and A.J. Olson, AutoDock Vina: improving the speed ...
  • Wallace, A.C., R.A. Laskowski, and J.M. Thornton, LIGPLOT: a program ...
  • OS, R., Recent changes to RasMol, recombining the variants. Biophys. ...
  • نمایش کامل مراجع