تعیین فیلوژنی انار با استفاده از بارکدهای گیاهی psbA-trnH, rbcL, matK و ITS

سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 917

فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CIGS12_0099

تاریخ نمایه سازی: 5 بهمن 1392

چکیده مقاله:

انار (Punica granatum) یکی از قدیمی ترین و مهمترین گیاهان باغی در ایران است. در اغلب مطالعات صورت گرفته با استفاده از نشانگرهای مولکولی مختلف مانند FLP, RAPD و SSR در انار، چندشکلی پائینی علیرغم تنوع مورفولوژیک مشاهده شده است. دلیل عدم همبستگی تنوع مورفولوژیک و مولکولی را به شرایط اقلیمی مختلف، تغییرات پس از نسخه برداری و ژن های سیتوپلاسمی مرتبط دانسته اند که یکی از عوامل سیتوپلاسمی در گیاهان کلورپلاست است. در پژوهش حاضر از چهار بارکد (rbcL, ITS, psbA-trnH و matK) در بررسی تنوع درون و برونگونه های سه خانواده ی Lythraceae, Punicaceae, Myrtaceae و همچنین مقایسه ی نتایج توالی سه خانواده مذکور با هدف تعیین موقعیت انار در سیستم رده بندی گیاهی، استفاده شد. DNA ژنومی از برگهای انار وحشی، اهلی، زینتی و گیاه «مورد» (به عنوان داده ی خارج گروهی از خانواده ی Myrtaceae) استخراج گردید و ژنهای مورد نظر توسط آغازگرهای اختصاصی، تکثیر و توالییایی شدند. نتایج نشان داد که در خانواده ی Myrtaceae میتوان از دو ناحیه ی (Coalescent depth-0/017417, ɵ=0/012676)ITS و (Colescent depth=0/003526, ɵ=0/00524)psbA-trnH به طور مکمل و در رابطه با خانواده ی Lythraceae از ناحیه ی (Coalescent depth=0/026418, ɵ=0/013953)ITS برای مطالعات فیلوژنی استفاده کرد. برخلاف خانواده ی Myrtaceae در خانواده ی Punicaceae بیشترین میزان تنوع مربوط به ناحیه ی (ɵ=0/0165) و پس از آن ناحیه) (ɵ =0/006 بود. نتایج حاصل از این تحقیق نشان داد که ناحیه psbA-trnH دارای اطلاعات فیلوژنتیک کافی برای تعیین روابط درونگونه ای انار است و بر اساس درختهای فیلوژنی انار در فاصله ی کمتری از خانواده ی Lythraceae نسبت به Myrtaceae قرار می گیرد.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

زهرا حاجی احمدی

دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی

مجید طالبی

عضو هیئت علمی دانشگاه صنعتی اصفهان

بدرالدین ابراهیم سیدطباطبایی

عضو هیئت علمی دانشگاه صنعتی اصفهان

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Akbar, S., 2006. Use of DNA markers to determine the ...
  • Edwards, D., Horn, A., Taylor, D ., Savolainen, V., Hawkins, ...
  • Fazekas, A. J., Burgess, K. S., Kesanakurti, P. R., Graham, ...
  • Hai-Fei, Y. A. N., Gang, H. A., Chi-Ming O. H. ...
  • Hebert, P. D. N., Cywinska, A ., Ball, S. L, ...
  • Kresss, W. J., Wurdack, K. J., Zimmer, E. A., Weigt, ...
  • Lahaye, R., vanderBank, M., Bogarin, D., Warner, J., Pupulin, F., ...
  • Murray, M. G., Thompson, W. F., 1980). Rapid isolation of ...
  • Yao, H., Song, J. Y., 2009. Identification of Dendrobium species ...
  • نمایش کامل مراجع