مطالعه فیلوژنتیک و شناسایی باکتری عامل لکه زاویه ای توسکای ییلاقی از طریق بررسی ژن rpoD

سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 552

فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CIGS12_0200

تاریخ نمایه سازی: 5 بهمن 1392

چکیده مقاله:

یکی از گونه های مهم در تولید چوب گونه توسکای ییلاقی (Alnus subcordata) است. این گونه با داشتن قدرت تثبیت کنندگی ازت خاک و با بیومس تولیدی زیاد به منظور زراعت چوب و همچنین جنگل کاری برای احیای مناطق مخروبه جنگل های شمال کشور بسیار مناسب است. در چند سال اخیر بیماری لکه برگی ناشی از گونه ای زانتوموناس در توسکا ییلاقی در جنگل های استان مازندران گزارش شده است که گونه آن هنوز به طور دقیق شناسایی نشده است. لذا هدف اجرای تحقیق حاضر تعیین موقعیت تاکسونومیکی باکتری زانتوموناس عامل لکه زاویه ای توسکای کشور با استفاده از بررسی توالی ژن rpoD به عنوان یکی از ژن های خ انه دار و حفاظت شده بود. در این راستا تعداد 14 جدایه باکتری که قبلاً با استفاده از آزمون های بیماری زایی، بیوشیمیایی و الگوی نقوش پروتئینی مورد ارزیابی قرار گرفته بودند، استفاده شد. پس از طراحی و ساخت پرایمرهای اختصاصی ژن rpoD تکثیر قطعه 730 نوکلئوتیدی در جدایه ها صورت پذیرفت. پس از خالص سازی و توالی یابی قطعات تکثیر شده همردیف سازی چندگانه (Multiple sequence alignment) با سایر توالی های موجود در بانک داده NCBI، نتایج نشان داد که جدایه های بومی دارای تنوع خوبی در توالی ژن مذکور می باشند. با اینحال توالی های بدست آمده از جدایه های مذکور بیش از 98 درصد با توالی های rpoD در گونه Xanthomonas arboricola شباهت داشتند. این نتایج بیانگر این است که عامل این بیماری در توسکای ییلاقی در کشور متعلق به جنس و گونه Xanthomonas arboricola می باشد.

نویسندگان

نسیم بافنده

دانشجوی کارشناسی ارشد بیماری شناسی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

غلامرضا صالحی جوزانی

استادیار بخش بیوتکنولوژی و ایمنی زیستی پژوهشکده بیوتکنولوژی کشارزی ایران (ABRII)

حشمت الله رحیمیان

استاد بیماری شناسی گیاهی، دانشکده علوم زراعی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی، ساری

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • -رحیمیان، ح. ع. برزگر، ف. عربی و ز. نیک روش ...
  • رحیمیان، ح، ز نیک روش، ف. عربی وع. زارعی. 1383. ...
  • -رحیمیان، ح. ع. برزگر، ز. نیک روش و ف. عربی ...
  • _ _ D.-C., Shearmanb, H.M., Fargier, E..2008. ...
  • Parkinson, N. , Cowie, C. , Heeney, J. , Stead, ...
  • Parkinson, N., Aritua, V. , Heeney, J., Cowie, C., Bew, ...
  • Glazunova, O _ , Raoult, D. , Roux, V .2009. ...
  • Marcelletti, S., Ferrante, _ , Scortichini, M.2010. Multilocus Sequence Typing ...
  • Tseng, Y.S., Yu, C.T., Tseng, Y.H., Yang, M.T.1997. Cloning, Sequencing, ...
  • نمایش کامل مراجع