سناسایی مارکرهای تشخیصی در سرطان پروستات با استفاده از EST-SSRs

سرطان پروستات دومین بدخیمی شایع در میان مردان سراسر جهان است. از SSR ها به علت فراوانی و تنوع گسترده، هم غالبی و چند آلل در مطالعات ژنتیکی استفاده می شود. تا کنون مطالعات زیادی در ارتباط میان SSR ها و سرطان پروستات انجام شده است که نقش توالیهای تکراری CAG تا حدودی در ارتباط با سرطان پروستات مشخص شده است. هدف: بررسی EST-SSR ها در بافتهای سرطانی و نرمال پروستات به منظور شناسایی نوع و تعداد SSR ها و معرفی مارکرهای تشخیصی در سرطان پروستات. روش: کتابخانه EST مربوط به بافت سرطانی و نرمال پروستات از دانشگاه هاروارد توسط نرم افزار MEGA دانلود و با استفاده از نرم افزار SSR Locator نوع و تعداد SSR های موجود در EST ها بررسی گردید. جهت انجام PCR مجازی برای SSR های شناسایی شده با استفاده از برنامه Primer3 پرایمر طراحی شد. نتایج PCR توسط نرم افزار SPSS آنالیز شد. نتیجه: نتایج حاصل از آنالیزهای آماری اختلاف معنی دار (P<0.05) را بین SSR های تری نوکلئوتید و پنتا نوکلئوتید بافت سرطانی و نرمال نشان داد. همچنین این دو بافت از لحاظ نوع و تعداد اسیدهای آمینه از هم متفاوت بودند به طوری که فراوانی اسید آمینه های سیستئین و والین دوبرابر بافت نرمال بود. در میان SSR های شناسایی شده فراوانی AGC در بافت سرطانی پروستات بیش از شش برابر بافت نرمال بود. پنتا نوکلئوتیدهای CCCAG و TTTTG تنها در بافت سرطانی حضور داشتند و به تنهایی بیش از یک چهارم فراوانی پنتانوکلئتیدیهای سرطانی را به خود اختصاص دادند. از این SSR ها می توان به عنوان مارکر تشخیصی در سرطان پروستات استفاده کرد.

کلیدواژه ها:

سرطان پروستات ، SSR ، EST