مقایسه بیوانفورماتیکی ژن های مولد هسته یخ در چند گونه باکتری گرم منفی

باکتریهای مولد هسته یخ با افزایش جمعیت و فعالیت خود منجر به وقوع سرمازدگی گیاهان در دماهای بالاتر از معمول می گردند. توالی نوکلئوتیدی و اسید آمینه ژن های مولد هسته یخ متعلق به 12 جدایه از 6 گونه باکتریایی با فعالیت تولید هسته یخ از پایگاه داده بانک ژن بازیابی و تفاوت ژنی و پروتئینی میان و بین گونه ها مورد مطالعه قرار گرفت. تنوع نسبتاً زیادی میان طول توالی های نوکلئوتیدی (3735 تا 5360 جفت باز) مشاهده گردید. گونه های Pseudomonas نسبت به گونه های Pantoea دارای تنوع نوکلئوتیدی بیشتری در ژن ina بودند. این تفاوت در میان جدایه های مختلف گونه P. syringae هم مشاهده شد. ژن ina متعلق به باکتری Xanthomonas translucens تفاوت زیادی با سایر ژنها نشان داد و این باکتری در درخت فیلوژنتیکی ترسیمی در یک گروه کاملاً جدا قرار گرفت.

کلیدواژه ها:

آنالیز بیوانفورماتیکی ، ژن مولد هسته یخ ، گونه های باکتری