تجزیه و تحلیل ترجیح کدونی در ژن های رمز کننده پمپ پروتونی غشای پلاسمایی در گیاهان مختلف

به منظور مقایسه و بررسی ترجیح کدونی در ژن های رمز ک ننده پمپ پروتونی غشای پلاسمایی در گیاهان مختلف 54 ژن از 15 گیاه از پایگاه داده NCBI جمع آوری شد. کدون های مختلف در این ژن ها با استفاده از سایت GENE INFINITY تجزیه و تحلیل شدند و فراوانی نسبی هر یک از کدون های مترادف و کدون های با فراوانی بالا بدست آمد. نتایج نشان دادند که برای اسید آمینه هایی که بیش از دو کدون داشتند در اکثر مارد کدونی ترجیح داده شده بود که در انتهای خود دارای نوکلئوتید U بود. برای مثال می توان به CUU برای لوسین، AGU برای سرین GCU برای آلانین، GGU برای گلیسین، GUU برای والین و AUU برای ایزولوسین اشاره کرد. برای اسید آمینه هایی که دارای دو کدون بودند در اکثر موارد کدونی ترجیح داده شده بود که در انتهای خود دارای نوکلئوتید C یا G بود. برای مثال می توان به UGC برای سیستئین، GAU برای آسپارتیک، GAG برای گلوتامیک، UUC برای فنیل آلانین، CAC برای هیستیدین، AAG برای لیزین، AAC برای آسپارژین، CAG برای گلوتامین و UAC برای تیروزین اشاره کرد. در نهایت می توان گفت که در اکثر گیاهان مورد بررسی ترجیح کدونی یکسانی برای ژن های رمز کننده پمپ پروتونی وجود داشت.

کلیدواژه ها:

ترجیح کدونی ، پمپ پروتونی غشای پلاسمایی ، گیاه