بررسی امکان استفاده از پلی مورفیسم ژن 16SrDNA کلروپلاستی در شناسایی و طبقه بندی ریزجلبک دونالیلا

سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 870

متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CIGS12_0728

تاریخ نمایه سازی: 5 بهمن 1392

چکیده مقاله:

در تشخیص روابط فیلوژنتیکی جلبکهای سبز از مارکرهای مولکولی شامل ژنهای هسته ای (185rDNA, ITS) و ژنهای کلروپلاستی (16S rDNA, PcaB) استفاده می شود. مطالعات براساس 18S rDNA و ITS در مورد جلبک دونالیلا در ایران در پژوهشکده بیوتکنولوژی شمالغرب و غرب کشور صورت گرفته است و 20 ایزوله در سایت بانک جهانی NCBI به ثبت رسیده است. در این تحقیق برای اولین بار در دنیا، به بررسی پلی مورفیسمی ژن 16S Rdna لروپلاستی جنس دونالیلا پرداخته شده است. ژن 16S rDNA که جزء ژنهای حفاظت شده است، اندازه ای در حدود 1200 جفت باز دارد. جهت جداسازی این ژن، ابتدا تنها توالی 16S rDNA ثبت شده در بانک ژنی NCBI که مربوط به گونه دونالیلا سالینا بود، جمع آوری شد و با کمک برنامه Oligo5 بهترین جفت پرایمر از دو انتهای ژن طراحی گردید. 8 ایزوله از بانک جلبک پژوهشکده بیوتکنولوژی شمالغرب و غرب کشور انتخاب شدند و ژن 16S rDNA آنها توسط واکنش PCR تکثیر یافت. اندازه باند به دست آمده در حدود 1200 جفت باز بود. قابل ذکر است که مراحل تکمیلی این تحقیق در حال انجام بوده و نتایج حاصل از توالی یابی این ژن گزارش خواهد شد.

نویسندگان

گوهر تاج شیخ پروین

پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، منطقه شمالغرب و غرب کشور، تبریز، ایران

محمدامین حجازی

پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، منطقه شمالغرب و غرب کشور، تبریز، ایران

ناهید حسین زاده

پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، منطقه شمالغرب و غرب کشور، تبریز، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Avron, M. and Ben-amotz, A. 1992. "Dunaliella: Physiology, biochemistry, and ...
  • Borowitzka, M.A., Siva, C. 2007. The taxonomy of the genus ...
  • Hejazi, M.A., de Lamarliere, C., Rocha, J.M.S., Vermuc, M., Tramper, ...
  • Hejazi, M.A., Barzegari, A., Hosseinzadel Gharajeh, N., Hejazi, M.S. 2010. ...
  • G6mez PI, Gonzalez MA.2004. Genetic variation among seven strains of ...
  • Olmos J, Paniagua J, Contreras R.2000. Molecular identification of Dunaliella ...
  • نمایش کامل مراجع