طبقه بندی سرطان ریه براساس خصوصیات مهم ساختاری و فیزیکوشیمیایی پروتئین های درگیر در انواع تومورهای ریوی با استفاده از مدل های داده کاوی

تشخیص انواع تومورهای ریوی (تومورهای با یاخته های کوچک ((SCLC و تومورهای با یاخته های بزرگ (NSCLC) در روش درمان این بیماری بسیار مهم است. بعلاوه خصوصیات ساختاری و فیزیکوشیمیایی برگرفته از توالی برای پی گویی کلاس های ساختاری و عملکردی و همچنین طبقه بندی پروتئین ها بسیار مفید می باشند. بنابراین در این مطلعه، طبقه بندی انواع تومورهای ریوی بر اساس 1497 خصوصیت ساختاری و فیزیکوشیمیایی برگرفته از توالی پروتئین های مربوطه (براساس ژن های تعریف شده با آنالیز میکرواری) از طریق ترکیبی از الگوریتم های وزن دهی و دسته بندی مورد بحث قرار گرفته است. براساس 80 درصد مدل های وزن دهی، خصوصیات خودهمبستگی، ترکیب دی پپتیدها و توزیع هیدروفوبیسیته به عنوان مهمترین خصوصیات در طبقه بندی کلاس های توموری NSCLC. SCLC و COMMON انتخاب شدند. نتایج یکسانی توسط الگوریتم های ایجاد درخت به دست آمد، توزیع هیدروفوبیسیته در پروتئین های مشترک بین دو کلاس توموری، بالا و توزیع بار در این پروتئین ها بسیار پائین بود که نشاندهنده ی آبگریزی پروتئین های مشترک بین دو نوع تومور می باشد. همچنین ترکیب دی پپتیدهای قطبی در پروتئین های SCLC بیش از پروتئین های NSCLC و COMMON بود. برخی مدل های کلاسترینگ به طور تقریبی قادر به دسته بندی پروتئین های SCLC و NSCLC بودند. بدین وسیله برای اولین بار کاربرد ابزارهای داده کاوی برای طبقه بندی سه کلاس توموری ریه با توجه به اهمیت خصوصیات ترکیب دی پپتیدها، خودهمبستگی و توصیفگر توزیع گزارش شده است.

کلیدواژه ها:

، NSCLC ، SCLC ، الگوریتم های وزن دهی ، درخت تصمیم و مدل های کلاسترینگ