بررسی بیوانفورماتیکی ناحیه پروموتر ژن های رمز کننده H(+) - ATPase غشای پلاسمایی در Arabidopsis thaliana
محل انتشار: دوازدهمین کنگره ژنتیک ایران
سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 656
متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CIGS12_1031
تاریخ نمایه سازی: 5 بهمن 1392
چکیده مقاله:
؛ H(+)- ATPase غشای پلاسمایی یکی از مهمترین پروتئین های عملکردی است که نقش مهمی در فعالیت های فیزیولوژیک گیاه دارد. الگوی بیان ژن رمز کننده این پمپ تحت تأثیر تغییرات محیطی تغییر می کند. در گیاهان مختلف از جمله آرابیدوپسیس ایزوفرم های مختلفی از این پمپ پروتونی گزارش شده است. در این مطالعه به منظور بررسی عناصر تنظیمی موجود در پروموترهای ایروفرم های مختلف این ژن، 11 ایزوفرم مختلف ژن رمز کننده پمپ پروتونی (HA) از نظر عناصر تنظیمی موجود در پروموتر آنها با استفاده از سایت Plant care مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. نتایج نشان دادند که ایزوفرم AHA7 دارای بیشترین تعداد موتیف است و در بین موتیف ها عناصر تنظیمی CAAT-box و TATA-box بیشترین تعداد را شامل می شدند. I-box که نقش آن در پاسخ به نور است در AHA2 و AHA9 وجود نداشت در حالی که در سایر ایزوفرم ها دیده شد. درخت فیلوژنی با روش Neighbor – joining که میزان ضریب اطمینان شباهت بین ایزوفرم ها را نشان می دهد رسم شد. همچنین نتایج نشان دادند که ایزوفرم هایی که از نظر تعداد عناصر تنظیمی موجود در پروموتر شبیه به هم هستند در یک گروه قرار می گیرند.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
محسن جم
دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز
محمدفاضل سلطانی
دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز
عباس عالم زاده
استادیارر بخش زراعت و اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :