ارزیابی فیلوژنی آنزیم بتاکاروتن هیدروکسیلاز در جنس Crocus sp با استفاده از آنالیز In silico

زعفران گیاه بومی ایران است که شامل خواص داروئی و غذایی مختلف می باشد. زعفران ترکیبات فرار بسیاری دارد که قسمت اعظم آنها را کاروتنوئیدها تشکیل داده اند و شامل زآزانتینی، لیکوپن و آلفا و بتاکاروتنهای مختلف می شوند. آنزیم بتاکاروتن هیدروکسیلاز یکی از آنزیمهای مسیر سنتز بتاکاروتن در گ یاهان است. جنس Crocus متعلق به خانواده Iridaceae دارای گونه های مختلفی است.این جنس را بیشتر به خاطر گونه زراعی Crocus sativus می شناسند. سایر گونه های وحشی بوده و برخی از آنها به دلیل داشتن گلهای زیبا در باغبانی استفاده می شود مانند گونه Crocus speciosus. بیوانفورماتیک ابزار حساسیت که نه تنها در زمینه مطالعات پایه ای که در زمینه های علوم بیوتکنولوژی بیودارویی بخصوص در سالهای اخیر بسیار مورد استفاده است. در این تحقیق با استفاده از آنالیز In silico توالیهای Fasta کامل آنزیم بتاکاروتن هیدروکسیلاز در 8 گونه از جنس Crocus شامل که بوسیله سایت NCBI بدست آمد. توسط نرم افزار آنلاین EMBle-Ebi میزان شباهتها بین گ ونه های مورد مطالعه از لحاظ این آنزیم رسم گردید و نیز از طریق نرم افزار MEGA 4 درخت فیلوژنی بدست آمد. براساس نتایج گونه های مورد مطالعه این جنس در دو گروه عمده قرارگرفتند. در گروه دوم تنها نمونه Crocus vernus قرار گرفت و در گروه اول که شامل دو زیرگروه است، زیرگروه اول نمونه های Crocus cartwrightianus, Crocus sativus, Crocus oreocreticus, Crocus tomasii, Crocus biflorus و Crocus pallasii و زیرگروه دوم شامل نمونه Crocus speciosus است.

کلیدواژه ها:

، Crocus sp ، بتاکاروتن هیدروکسیلاز ، بیوانفورماتیک