مطالعه فیلوژنی دامنه NBS کد شوند با ژنهای مقاومت در مرکبات

مرکبات در ایران از اهمیت اقتصادی زیادی برخوردار است و ایران از نظر تولید مرکبات در جهان در رتبه هشتم قرار دارد. در سالهای اخیربیماریهای خسارتزایی مانند میوه سبز مرکبات از منطقه جنوب کشور گزارش شده است که به دلیل ماهیت عامل بیماریزای آنها، کنترلبیماری مشکل میباشد. در حال حاضر استراتژی کارآمد برای کنترل این بیماری استفاده از گیاهان مقاوم به این پاتوژن می باشد. گیاهانمکانیسمهای مختلفی را برای دفاع در مقابل پاتوژنها به کار میبرند. این مکانیسمها با ژنهای مقاومت گیاهR genesفعال می شوند . بیشتر پروتینهای رمز شده توسط ژنهای مقاومت دارای یک محل اتصال به نوکلیوتیدNucleotide Binding Site :NBSهستند که به یک تکرار غنی از لوسینLeucien-Rich Repeats:LRR با طول متغیر در انتهای کربوکسیل متصل می شوند. در این بررسی ابتدا به مطالعه ژنهای آنالوگ مقاومت در مرکبات پرداخته شده است. به این منظور حدود سی گونه مختلف مرکبات موجود در کلکسیون های ایران تهیه وDNAآنها با روشCTABاستخراج شد. پرایمرهای دجنریت برای تکثیر ژن های آنالوگ مقاومت با استفاده از روش های بیوانفورماتیک طراحی گردید. در مجموع 512 قطعه چند شکل حاصل شد که قطعات چندشکلی از روی ژل آکریل آماید جداسازی وتوالی یابی شدند. از نظر فیلوژنی توالی آنالوگ ژنهای مقاومت در ارقام زینتی و محلی ایران با توالی های موجود در بانکهای اطلاع اتی در شاخه های مجزا قرا میگیرند که از آنها میتوان در مکانیابی ژنهای مقاومت منفرد و تعیین مک انها ی کم ی مقاومت به بیمار یها در مرکبات استفاده نمود

کلیدواژه ها:

مقاومت ، Candidatus liberibacter asiaticus .NBS-LRR