تجزیه و تحلیل in silico برهمکنش گندم و قارچ بیمارگر Zymoseptoria tritici
سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 652
فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CIGS13_0198
تاریخ نمایه سازی: 7 بهمن 1393
چکیده مقاله:
دراین بررسی، همه ESTهایی که در سایتNCBIدر رابطه با تعامل گندم و بیمارگرZymoseptoria triticiثبت شده بودند، استخراج شدند. تعداد آن ها بالغ بر 10438 بود. سپس پروتئینهای غیر تکراری و مرتبط باESTها در بانک اطلاعاتیNCBIتوسط نرم افزارSeqtoolsبه دست آمدند. این پروتئین ها بر اساس تشابه نام طبقه بندی و در 279 گروه قرار گرفتند. با جستجو در سایتKEGG 112 عدد از این پروتئینها دارای مسیر بودند و در مرحله بعد، ارتباط بین این مسیرها و پاسخهای دفاعی گیاه گندم مورد بررسی قرار گرفت.در ادامه این مسیرها بر اساس عملکرد گروهبندی و در هشت گروه عملکردی قرار گرفتند. گروههای عملکردی شامل 1 - پروتئینهایدفاعی 2 - پروتئینهای دخیل در فرایند انرژی سلولی 3- پروتئینهای دخیل در فرایند متابولیسم سلولی 4- پروتئینهای دخیل در فرایند پردازش پروتئینها 5 - پروتئینهای دخیل در فرایند پردازشRNA6 - پروتئینهای دخیل در چرخههای سلولی 7- پروتئینهای دخیل درتخریب پروتئین ها و 8- پروتئینهای دخیل در فرایند سیگنالدهی سلولی بودند
نویسندگان
جلال غلام نژاد
دانشجوی دوره دکتری بیماریشناسی گیاهی، دانشگاه تربیت مدرس)
فروغ سنجریان
استادیار پژوهشگاه ملی مهندسی ژنیک و زیست فناوری)
ابراهیم محمدی گل تپه
استاد دانشکده کشاورزی دانشگاه تربیت مدرس، بخش بیماریشناسی گیاهی
ناصر صفایی
دانشیار دانشکده کشاورزی دانشگاه تربیت مدرس، بخش بیماریشناسی گیاهی
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :