تجزیه و تحلیل in silico برهمکنش گندم و قارچ بیمارگر Zymoseptoria tritici

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 652

فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CIGS13_0198

تاریخ نمایه سازی: 7 بهمن 1393

چکیده مقاله:

دراین بررسی، همه ESTهایی که در سایتNCBIدر رابطه با تعامل گندم و بیمارگرZymoseptoria triticiثبت شده بودند، استخراج شدند. تعداد آن ها بالغ بر 10438 بود. سپس پروتئینهای غیر تکراری و مرتبط باESTها در بانک اطلاعاتیNCBIتوسط نرم افزارSeqtoolsبه دست آمدند. این پروتئین ها بر اساس تشابه نام طبقه بندی و در 279 گروه قرار گرفتند. با جستجو در سایتKEGG 112 عدد از این پروتئینها دارای مسیر بودند و در مرحله بعد، ارتباط بین این مسیرها و پاسخهای دفاعی گیاه گندم مورد بررسی قرار گرفت.در ادامه این مسیرها بر اساس عملکرد گروهبندی و در هشت گروه عملکردی قرار گرفتند. گروههای عملکردی شامل 1 - پروتئینهایدفاعی 2 - پروتئینهای دخیل در فرایند انرژی سلولی 3- پروتئینهای دخیل در فرایند متابولیسم سلولی 4- پروتئینهای دخیل در فرایند پردازش پروتئینها 5 - پروتئینهای دخیل در فرایند پردازشRNA6 - پروتئینهای دخیل در چرخههای سلولی 7- پروتئینهای دخیل درتخریب پروتئین ها و 8- پروتئینهای دخیل در فرایند سیگنالدهی سلولی بودند

نویسندگان

جلال غلام نژاد

دانشجوی دوره دکتری بیماریشناسی گیاهی، دانشگاه تربیت مدرس)

فروغ سنجریان

استادیار پژوهشگاه ملی مهندسی ژنیک و زیست فناوری)

ابراهیم محمدی گل تپه

استاد دانشکده کشاورزی دانشگاه تربیت مدرس، بخش بیماریشناسی گیاهی

ناصر صفایی

دانشیار دانشکده کشاورزی دانشگاه تربیت مدرس، بخش بیماریشناسی گیاهی

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Gilchrist, L, Gomez, B., Gonzalez, R., Fuentes, S., Mujeeb- Kazi, ...
  • Feller, U., Anders, I., Mae, T. (2008). "Rubiscolytics: fate of ...
  • Goodwin, S.B., McDonald, B.A., and Kema, GHJ. (2003). The Myco ...
  • Parkinson, J., and Blaxter, M. (2009). Expressed sequence tags: an ...
  • Rekah, Y., Shtienberg, D. & Katan, J. (1999). Spatial distribution ...
  • Rhodes, M.J. (1994). Physiological roles for secondary metabolites in plants: ...
  • نمایش کامل مراجع