آنالیز مولکولی جدایه ایرانی ویروس وای سیبزمینی با استفاده از توالی کامل ژنومی

ویروس وای سیبزمینیPVYاز خانوادهPotyviridaeو جنسPotyvirusیکی از مهمترین ویروسهای آلوده کننده گیاهان خانواده Solanaceaeمیباشد. در این بررسی توالی کامل یک جدایه ایرانی از نوع سویهPVYNجدا شده از سیبزمینی تعیین گردید. طول توالی کامل ژنوم این جدایه 9703 نوکلئوتید بود که شامل ژنهای مورد نظرCP و NIb ،NIa-pro ،VPg ،6K2 ،CI ،6K1 ،P3 ،Hc-pro ،P1 به ترتیب به طول 825 و،564 ،156 ،1902 ،156 ،1095 ،1395و732 و 801 نوکلئوتید بود. آنالیز تبارازیی نشان داد که جدایه ایرانی به همراه جدایههای اروپایی نوترکیب NTNدر تبار Nقرار گرفت. نتایج آنالیز نوترکیبی با استفاده از روشهای مختلف نشان دهنده وقوع نوترکیبی در ژنوم جدایه ایرانی بوده و این جدایه مشابه با ژنوم جدایههای اروپایی PVYNTN دارای والدینی از دو تبارPVYO و PVYNبود. نتایج بدست آمده با استفاده از نرمافزارSISCAN V2مورد تایید قرار گرفت. با استفاده از تعیین نسبت(ω) dN/dSمیزان فشار انتخابی موجوددر جمعیت PVY مورد مطالعه قرار گرفت

کلیدواژه ها:

فیلوژنی ، نوترکیبی ، تنوع