تعیین اپیتوپ های خطی و فضایی سلولهای لنفوسیتBدر پروتئینVP6روتاویروس

روتاویروس عامل اصلی اسهال حاد در کودکان زیر 5 سال است. تخمین زده میشود که سالانه 527000 کودک بر اثر اسهال روتاویروسی جان خود را از دست میدهند. روتاویروس دارای 11 قطعهRNAدو رشتهای در ژنوم است که کدکننده 6 پروتئین غیر ساختاری و 6پروتئین ساختاری است. پروتئینVP6 51 درصد حجم ویریون را به خود اختصاص میدهد، بسیار ایمونوژنیک است و هدف خوبی برای تستهای تشخیصی است. بر اساسVP6روتاویروسها به 7 گروهAتاG طبقه بندی میشوندگروهA اغلبدرعفونت های انسانی دیده میشود پروتئین های VP7 گلیکوپروتئین وVP6 حساس به پروتئاز) سروتایپهای روتاویروس را تشکیل میدهدP,G درگروه A 23سروتایپG و31سروتایپPوجودداردسویه های P[8]G ،P[8]G3 ،P[4]G2 ،P[8]G1 اغلب در عفونتهای انسانی مشاهده میشوند. به دلیل شیوع و مرگومیر قابل توجه در ارتباط با روتاویروس، نیاز ضروری برای گسترش واکسن احساس می شود. هدف از این مطالعه تعیین اپیتوپهایVP6روتاویروس در راستای کمک به ساخت واکسن و بهبود تستهای ایمنی تشخیصی است. در این مطالعه ما بر روی پروتئینVP6 تمرکز کردیم و با کمک همترازی پروتئین وDNAآن را مورد بررسی قرار دادیم.

کلیدواژه ها:

روتاویروس ، بیوانفورماتیک ، اپیتوپ خطی ، اپیتوپ فضایی