آنالیز مولکولی توالی ژن مقاوم به زنگ قهوهای Lr10 در گونههای وحشی و زراعی گندم با سطوح پلوئیدی مختلف

ژن Lr10 یکی از ژنهایی است که مقاومت به زنگ قهوهای در گندم را القاء میکند. هدف این مطالعه، بررسی تنوع اللی توالی ژنLr10درگونههای وحشی و زراعی گندم میباشد. در این بررسی از 9 توالی ژنLr10در گونههای وحشی و زراعی گندم که از پایگاه اطلاعات ژنتیکیNCBIاستخراج شده بود ، استفاده گردید. ابتدا توالی ژنLr10در گونههای مختلف گندم با استفاده از نرمافزار آنلاینBLASTبا توالی این ژن در گندم نان مقایسه شد. همردیفی توالی این ژن در گونهTriticum turgidum subsp. durumبا گندم نان 100 درصدمشابهت نشان داد. نتایج همردیفی توالی نوکلئوتیدی ژنLr10در نمونههای گندم مورد بررسی با استفاده از نرمافزارCLC Sequence Viewer 6 تنوع بالایی را در سطح ژنLr10برای گونههای مورد بررسی نشان داد. همردیفی توالی آمینواسیدی ژنLr10در نمونههای مورد بررسی نیز با استفاده از نرمافزارCLC Sequence Viewer6 انجام گرفت. نتایج، حاکی از تنوع پروتئینی میان گونههای مورد بررسی میباشد. نتایج آنالیز فیلوژنتیکی توالی ژنLr10با استفاده از الگوریتمUPGMA توسط نرمافزارCLC Sequence Viewer6براساستوالی نوکلئوتیدی و آمینواسیدی، گونهها را در 5 گروه تقسیمبندی نمود. ماتریس تشابه و فاصله توالی ژنLr10در گونههای موردبررسی، در سطوح نوکلئوتیدی و آمینواسیدی با نرمافزارMegAlignمحاسبه گردید. در سطوح نوکلئوتیدی و آمینواسیدی، بیشترین درصد مشابهت ( 100 درصد) میان گونههای گندم نان وTriticum turgidum subsp. durum و نیز میان دو گونهTriticum dicoccoides varTriticum dicoccoides var. kotschyi و macraaronsohniiمشاهده گردید.

کلیدواژه ها:

آنالیز فیلوژنتیکی ، ژنLr10 ، گندم ، همردیفی