مطالعه بیوانفورماتیکی توالیهای پروتئین پکتاتلیاز در نماینده گیاهان دولپهایArabidopsis thaliana و تکلپهای Oryza sativa
سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 574
فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CIGS13_0873
تاریخ نمایه سازی: 7 بهمن 1393
چکیده مقاله:
پکتاتلیازها آنزیمهایی از گروه پکتینازها هستند که توسط مکانیسم حذف بتا، پیوندa 1,4 گالاکترونیک اسید را میشکنند و موجب دپلیمریزه شدن پکتین دیواره سلولی میشوند. برای بررسی مشخصات بیوانفورماتیکی این آنزیم در دو گیاه برنج و آرابیدوپسیس تالیانا به عنوان نمایندگان گیاهان تکلپهای و دولپهای با استفاده از سایتClustalW و CAZyانجام و مشخص شد که تعداد پروتئینهای پکتات لیاز در آرابیدوپسیس تالیانا 26 ودر برنج 15 عدد میباشد که در 5 کلاستر مختلف تقسیم بندی میشوند. توسط سایتPfamدمینcبرای تمامی توالیهای پروتئینی پکتاتلیاز این دو گیاه و دمینNبرای برخی ازتوالیها شناسایی شد و موتیف های شناسایی شده درسایتMEMEشباهت نزدیکی با موجودات دیگر نشان داد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
سیده صدیقه قریشی امیری
دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی دانشگاه شاهرود
ناصر فرخی
استادیار گروه بیوتکنولوژی، دانشگاه شاهرود
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :