بررسی بیوانفورماتیکی پروتئینNac2 در گیاهان
سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 526
متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CIGS13_1258
تاریخ نمایه سازی: 7 بهمن 1393
چکیده مقاله:
به منظور بررسی بیوانفورماتیکی پروتئینNac2 در 7 گیاه مختلف، توالی مربوط به هر یک از پروتئینها از سایتuniprotگرفته شد سپس با استفاده از نرم افزارClustalWهمردیفی توالیها صورت گرفت و در ادامه برای مشخص کردن نواحی حفظ شده بین این توالیها از نرم افزارboxshadeاستفاده شد. نتایج حاصل از رسم درخت فیلوژنی نشان داد که این توالی در گیاهان مختلف در 5 دسته تقسیم بندی میشوند به طوری کهPhaseolus vulgaris و solanum tuberosumدر یک گروه وArabidopsis و Glaysin max thaliana در یک گروه قرار گرفتند. بشترین وزن مولکولی مربوطArabidopsis thalianaبا40/02کیلودالتونوکمترین آن مربوط به Phaseolus vulgaris با29/41کیلودالتون میباشد همچنین solanum tuberosumدارای بیشترین شاخص آلیفاتیک وGlaysin maxدارای بیشترین شاخص پایداری میباشد. همچنین بیشترین و کمترین میزان ضریب خاموشی به ترتیب مربوطPhaseolus vulgarisوGossypium hirstumمیباشد. در تمام گیاهان اسید آمینه سیستئین دارای کمترین تعداد بود و همهی توالیها دارای دومینNAMمیباشند.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
طیبه مشکانی
شیراز، دانشگاه شیراز، دانشکده کشاورزی، بخش زراعت و اصلاح نباتات،
محسن جم
شیراز، دانشگاه شیراز، دانشکده کشاورزی، بخش زراعت و اصلاح نباتات
عباس عالم زاده
شیراز، دانشگاه شیراز، دانشکده کشاورزی، بخش زراعت و اصلاح نباتات
حسن پاک نیت
شیراز، دانشگاه شیراز، دانشکده کشاورزی، بخش زراعت و اصلاح نباتات