پویش ژنومی صفات پشم در گوسفندان نژاد زندی با استفاده از مدل هاپلوتیپ

این تحقیق به منظور شناسایی جایگاه ها و ژن های مرتبط با صفات کیفی پشم، از طریق مطالعه ارتباط ژنومی هاپلوتیپی با استفاده از تراشه SNP ژنوم گوسفند (Illumnia SNPChip 50K Beadchip) یک جمعیت گوسفند زندی بود. برای هر دام، صفات کیفی شامل: طول استاپل (SL)، میانگین قطر الیاف (MFD)، ضریب تغییرات قطر الیاف (FDCV) و نسبت الیافی که مساوی یا بیشتر از 30 میکرومتر قطر الیاف (F≥30) پشم اندازه گیری شد. پس از شناسایی اثرات ثابت معنی دار، مطالعه کنترل ژنومیکی (GC) با استفاده از آماره لامبدا و پویش ژنومی بر پایه هاپلوتیپ در نرم افزار PLINK نسخه 1.90 با استفاده از مدل خطی معمول (GLM) ارتباط هر یک هاپلوتیپ ها با صفات کیفی پشم ارزیابی و برای کنترل نرخ اشتباه از تصحیح بنفرونی استفاده شد. دو ناحیه هاپلوتیپی شناسایی شده در داخل ژن های کاندیدا ERBB2 و GNASواقع شدند که پیشتر به عنوان ژن های موثر بر رشد و توسعه مو و پوست در انسان گزارش شده بودند.

کلیدواژه ها:

گوسفند زندی ، مطالعات پویش ژنومی ، کیفیت الیاف