شناساییin silico مولکول های miRNA و ژن های هدف آنها در گیاه نیشکر officinarum) (Saccharum

نیشکر یکی از گیاهان تیره گندمیان است. نیشکر از گیاهان مهم قندی است که کشت و کار آن سابقه طولانی دارد. miRNAها از طریق خاموشی ژن، نقش مهمی را در سطح رونویسی و پس از رونویسی تنظیم می کنند. در گیاهان، miRNAها کنترل فرآیندهای فیزیولوژیک و بیولوژیک و پاسخ به تنش های محیطی ایفا می کنند. تاکنون کشف تعدادی از miRNA های شناسایی شده در دیگر غلات در مقایسه با تعدادی از miRNA در گیاه نیشکر گزارش شده است اما این تعداد مانند برنج و ذرت، بسیار کمتر بوده و جای مطالعه دارد. حفاظت شده گی بالای این مولکول ها در گیاهان امکان شناسایی های جدید در گونه های گیاهی دیگر را از طریق همردیفی توالی ها فراهم می سازد. در این مطالعه از طریق بررسی miRNA و با استفاده از اطلاعات EST در پایگاه داده miRBase، تعداد چهار miRNA در گیاه نیشکر شاملmiRNA156e ، miR166f، miR2936 وmiR395a شناسایی گردید و همچنین ژن های هدف و فعالیت مولکولی هر یک از آنها نیز مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج نشان داد که miRNA156e بیشترین ژن هدف را شناسایی نمود. همچنین miR395a گروه آنزیم های دخیل در جابجایی سولفات را مورد شناسایی قرار داد.

کلیدواژه ها:

in silico ، microRNA ، نیشکر ، EST