مقایسه روش های استخراج DNA ژنومی باکتری Erwinia amylovora برای واکنش PCR

سال انتشار: 1388
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 3,635

فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

DEZFULWATERMECH01_031

تاریخ نمایه سازی: 21 فروردین 1391

چکیده مقاله:

در تمامی روش های مبتنی بر PCR برای اهداف مختلف، استخراج DNA گام اول و مهم می باشد. هر چه قدر روش استخراج DNA سریع، مقرون به صرفه وDNA حاصل دارای کیفیت بیشتری باشد، برای انجام PCR مناسب تر است. در این تحقیق، سه روش استخراج DNA از باکتری Erwinia amylovora مورد مطالعه قرار گرفتند. کمیت و کیفیت DNA ی استخراج شده با استفاده از روش الکتروفورز بر روی ژل آگاروز 1 درصد و اسپکتروفتومتری مشخص گردید. برای ارزیابی کیفیت DNA استخراج شده در برنامه PCR، تکثیر ژن hrpN با استفاده از آغازگرهای اختصاصی hrpN1 و hrpN2 در باکتری حامل این ژن، مورد مطالعه قرار گرفت. در نهایت، با توجه به معایب و مزایای مربوط به هر کدام از روش ها، بهترین روش برای استخراج DNA از باکتری E. amylovora جهت انجام آزمایشات مبتنی بر PCR پیشنهاد شده است.

کلیدواژه ها:

باکتری E. amylovora ، جداسازی DNA ، واکنش زنجیره ای پلیمراز و ژن .hrpN

نویسندگان

مریم راکی سلیمی

دانش آموخته بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی رامین (

محمد حسین دانشور

دانشیار گروه باغبانی دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی رامین (اهواز)

علی اکبر حبشی

هیئت علمی پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی کرج

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Ausbel, F. M., Brent, R., Kingston, R. E., Moore, D. ...
  • Cheng, H. R., and Jiang, N. 2006. Extremly rapid extraction ...
  • Flamm, R. K., Hinrichs, D. J., and Thomashow, M. F. ...
  • Ligozzi, M., and Fontana, R. 2003. Isolation of total DNA ...
  • Miller, F. M., Werner, K. E., Kasai, M., Francesconi, _ ...
  • Neumann, B., Pospiech, A., and Schairrer, H. U. 1992. Rapid ...
  • Owens, R. J., and Borman, P. 1987. A rapid biochemical ...
  • Sambrook, J., Fritsch, E. F., Maniatis, T 2001. Molecular Cloning: ...
  • Syn, C. K., and Swarup, S. 2000. A scalable protocol ...
  • Thomson, S. V. 2000. Epidemiology of fire blight. In: Vanneste ...
  • Troyer, D. L., Reed, A., Oberst, D., and Chengappa, M. ...
  • Wilson, K. 1990. Preparation of genomic DNA from bacterial Molecular ...
  • Graduate Student, Ramin University of Agriculture and Natural Resources maryam ...
  • Associate Professor, Ramin University of Agriculture and Natural Resources ...
  • Staff Member, Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran, P.O. Box ...
  • نمایش کامل مراجع