کاربرد روشPCR-RFLP ژنوم کلروپلاست جهت ارزیابی روابط هاپلوتایپی برخی ژنوتیپ های چای ایران

روش واکنش زنجیرهای پلیمراز- تفاوت طول قطعات حاصل از هضم (PCR-RFLP ) برای اولین بار در ایران برای ارزیابی و مشخص نمودن روابط هاپلوتایپی و ساختار جمعیتی در 14 ژنوتیپ چای از سه کشور ایران، هند (آسام) و ژاپن بکار رفت. سه آغازگر عمومی کلروپلاست HK)، DT و (B1B2 و یک آنزیم برشی (AluI) در این بررسی استفاده شدند و از ژل آگارز برای تفکیک باندها استفاده شد. آغازگر B1B 2 به علت تولید چندین باند در این بررسی قابل بهره برداری نبود. همچنین آغازگر DT پس از برش حالت یک شکلی تولید کرد و فقط برش قطعات حاصل از پرایمر HK حالت چند شکلی نشان داد. جهشهای مشخص شده توسط ترکیب پرایمر- آنزیم برشی HK-AluI جهشهای حذف- اضافه در محدوده 20-50bp بودند که نمونه ها را در پنج هاپلوتایپ H1)، H2، H3، H4 و (H5 گروهبندی نمودند. توزیع نمونه ها در گروه های هاپلوتایپی با توزیع جغرافیایی همخوانی نداشت و هیچ هاپلوتایپی خاص یک سری نمونه نبود. با توجه به نتایج میتوان بیان کرد کها روش PCR-RFLP روشی مناسب برای بررسی تنوع ژنتیکی ژنوتیپهای چای در سطح اندامکی میباشد.

کلیدواژه ها:

پرایمر عمومی کلروپلاست ، جهش ، ژل آگارز ، آنزیم برشی