شناسایی مولکولی و تعیین رابطه فیلوژنتیکی میان لاکتوباسیل های جدا شده از دو نمونه خمیر ترش صنعتی وسنتی

هدف از این پژوهش، شناسایی مولکولی لاکتوباسیل جدا شده از دو نمونه خمیر ترش محلی تربت جام وآلمان(سنتی و صنعتی) با استفاده از روش مولکولی در سطح DNA می باشد. بدین منظور خمیر ترش بر اساس خصوصیات ارگانولپتیکی (عطر و طعم) از شهرستان تربت جام جمع آوری گردید. پس از استخراج DNA از خمیر تکثیر قطعه 253 جفت بازی از ژن 16s RNA ریبوزومی توسط آغازگرهای مختص شناسائی لاکتو باسیل انجام گرفت. سپس قطعات تکثیر شده تعیین توالی شدند. نتایج بدست آمده نشان داد که در موقعیت 182 و 202 به ترتیب تغییرات نوکلئوتیدی A/C و T/C وجود دارد دارد که در موقعیت 182 اسیدآمینه هیستیدین به پرولین و در موقعیت 208 اسید گلوتامین به کدون پایان تغییر یافته است همچنین توالی نهایی بدست آمده از نمونه تربت با طول 253 جفت باز شامل 24/1 درصد آدنین، 22/1 درصد گوانین، 27/3 درصد سیتوزین و 26/5 درصد تیمین بود. نتایج فیلوژنتیکی با استفاده از روش Neighbor-Joining نشان داد، که باکتری Lactobacillus plantarum جدا شده ازخمیر ترش تربت کمترین فاصله ژنتیکی با آلمان ، چین و هلند و بیشترین فاصله ژنتیکی با Lactobacillus plantarum فرانسه دارد.

کلیدواژه ها:

اسید لاکتیک ، خمیر ترش ، ژن 16Sr RNA ، تعیین توالی