ارزیابی دقت نرم افزارهای پیش بینی کننده ساختارهای ساقه -حلقه شبه پیش سازهای microRNA در ژنوم انسان

این microRNAها، مولکول های RNA کوچک غیرکدکننده ای هستند که تنظیم بیان هزاران ژن در انسان را عهده دار هستند و در بسیاری از فرایندهایدخیل در بیماری و سلامتی نقش دارند. شناسایی این عوامل سلولی از اهمیت بالایی برخوردار است. نرم افزارهای زیادی برای پیش بینی وجودmicroRNA ها در انسان طراحی شده اند. علارغم اینکه این نرم افزارها در شناسایی این عوامل مؤثراند ولی میزان دقت و صحت آن ها در پیش بینی و شناساییmicroRNA های جدید متفاوت است. در این مطالعه به صورت تصادفی،05 مورد از توالی های پیش سازmicroRNA های انسانی موجود در سایتmiRBase انتخاب و با استفاده از نرم افزارهای پیش بینی کننده ساختارهای ساقه- حلقه شبه microRNA آنالیز شدند. نتیجه این آنالیز نشان داد که نرم افزار ssc- Profiler بیش از سایر نرم افزارها در شناسایی پیش سازهای واقعی microRNA ها در ژنوم توانمند است.

کلیدواژه ها:

نرم افزارهای بیوانفورماتیکی ، پیش بینی ساختارهای miRNA