شناسایی و طبقه بندی پایگاه های اطلاعاتی بر خط گیاهان تراریخته

بیوانفورماتیک ترکیبی از اطلاعات، زیست شناسی و داده پردازیهای مبتنی بر مدلها و محاسبات ریاضی و رایانهای است که می توان در جمع آوری دادهها،ثبت و تحلیل اطلاعات لازم در زمینه تحقیق و تولید گیاهان تراریخته از آن بهره برد. گیاهان تراریخته در سالهای اخیر با هدف کسب امنیت غذایی وکاربردهای مختلف صنعتی و بهداشتی رشد و توسعه قابل توجهی یافته اند. سطح زیر کشت گیاهان تراریخته طی سالهای 1996 تا 2011 (پانزده سال) در کشورهای جهان از 7/1 میلیون هکتار به 160 میلیون هکتار رسیده است. این مطالعه با هدف شناسایی و طبقه بندی پایگاههای اطلاعاتی گیاهان تراریختهانجام شده است. در این مطالعه 72 پایگاه داده برخط واجد اطلاعات مختلف درباره گیاهان تراریخته بررسی شدهاند. این پایگاههای داده در چهار بخش کلیمنشا صفات القایی، مشخصات گیاهان تراریخته، بررسی تنوع زیستی و بررسی و تشخیص ایمنی زیستی گیاهان تراریخته قابل تقسیم بند یان د. هر کدام ازبخشها شامل منابع تحت وب مرتبط می باشند که فهرست وار معرفی می شوند و توضیحات بیشتر در متن مقاله درج شده است. الف- منشا صفات القایی: 1- پایگاه توالی نوکلئوتیدی EMBL ، 2- پایگاه توالی پروتئینی Swiss Prot، 3- مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژیNCBI ، 4- پایگاه دادهDNA ژاپنDDBJ، 5- نقشه توالی برای آنالیز فیلوژنتیکی ژنهای گیاهی SPPG، ب- مشخصات گیاهان تراریخته: 1- اسناد اجماعیOECD ، 2- آژانس بازرسی غذاکانادا CFIA ، 3- سیستم اطلاعات تحقیقات GMO هند IGMORIS، ج- تنوع زیستی: 1- اطلاعات تنوع زیستی جهانیGBIF ، 2- پایگاه تنوع زیستیEUNIS، 3- پایگاه تنوع زیستی BIODIVERSLIFE، 4- پایگاه تنوع زیستی BIOTA2، 5- پایگاه آرتروپودها، مقاومت به آفتکشهاAPRD ، 6- اثراتغیر هدف محصولات گیاهی Bt، 7- منابع گیاهی نواحی گرمسیری آفریقاPROTA ، 8- سرویس ذخیره منابع طبیعی گیاهیNRCS ، 9- شار ژنیGISWEB، 01- گونه های مهاجم ISSG، 11- علفهای هرز مقاوم به علفکشها ISHRW، 21- تداخلGM و د- تشخیص و ایمنی زیستی محصولاتتراریخته: 1- روشهای مرجع برای آنالیز GMO، 2- روشهای تشخیص GMO، 3- ارزیابی ریسک مرکز RASM ،ICGEB، 4- مرکز ارزیابی ریسک محیطیCERA، 5- ظرفیت بیوتکنولوژی کشاورزی PRRI، 6- ایمنی GMO

کلیدواژه ها:

پایگاههای داده ، برخط ، گیاهان تغییر یافته ژنتیکی GMPs))