از قارچ در دو فرم اختصاصی(TEF) translation elongation factor مقایسه بیوانفورماتیکی ژن عامل پژمردگی آوندی خیار Fusarium oxysporum

سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 803

نسخه کامل این مقاله ارائه نشده است و در دسترس نمی باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

IBIS04_144

تاریخ نمایه سازی: 14 شهریور 1393

چکیده مقاله:

خیار یک محصول با اهمیت اقتصادی بالا در بسیاری از کشورهای دنیا می باشد. بیماری پژمردگی و زردی خیار ناشی از قار چ Fusarium oxysporum بادو فرم اختصاصیFusarium oxysporum f. sp radicis cucumerinum (Forc) و Fusarium oxysporum f. sp cucumerinum (Foc) از بیماریهای مخرب و از عوامل محدود کننده محصول به حساب می آید. به منظور آنالیز و بررسی میزان تنوع بین این دو فرم اختصاصی آلوده کننده خیار، توالینوکلئوتیدی و اسید های آمینه ژن TEF 21 جدایه ( شامل شش جدایه مربوط به هر کدام از فرم های اختصاص ی) از پایگاه داده بانک ژن بازیابی و تفاوتژنی و پروتئینی میان و بین آنها مورد مطالعه قرار گرفت. در درخت فیلوژنتیکی رسم شده بر اساس توالی های مورد مطالعه، جدایه های مربوط به هر فرمتخصصی در گروه های جداگانه قرار گرفتند. مقایسه ماتریکس تشابه بین این جدایه ها تشابه بالای98 درصد را نشان می دهد. کمترین میزان تشابه بینایزوله DQ220095 مربوط به فرم اختصاصی Foc و ایزوله EF056768 مربوط به فرم اختصاصی Forc به میزان 89.9 درصد می باش د. تن وع نوکلئوتیدی وتعداد متوسط تفاوت های نوکلئوتیدی در بین تمامی جدایه ها به ترتیب برابر 0.007 و 4.727 بود. نتایج نشان می ده د که جدایه هایی که به یک فرمتخصصی مربوط می باشند از لحاظ ژنتیکی تشابه زیادی با جدایه های فرم های تخصصی دیگر قارچ که به یک میزبان حمله می کنند، دارند.

نویسندگان

ایمان شهابی

دانش آموخته کارشناسی ارشد بیماری شناسی گیاهی

خدیجه سالاری

عضو هیئت علمی بخش گیاهپزشکی دانشگاه جیرفت