CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)
عنوان
مقاله

An improved model of class C GPCR family member sweet taste receptor : construction and dynamics

اعتبار موردنیاز PDF: ۰ | تعداد صفحات: ۱ | تعداد نمایش خلاصه: ۷۰ | نظرات: ۰
سال انتشار: ۱۳۹۶
کد COI مقاله: IBIS07_094
زبان مقاله: انگلیسی
نسخه کامل مقاله در کنفرانس ارائه نشده است و در دسترس نیست.

راهنمای دانلود فایل کامل این مقاله

متن کامل این مقاله منتشر نشده و درپایگاه سیویلیکا موجود نمی باشد.

منبع مقالات سیویلیکا دبیرخانه کنفرانسها و مجلات می باشد. برخی از دبیرخانه ها اقدام به انتشار اصل مقاله نمی نمایند. به منظور تکمیل بانک مقالات موجود، چکیده این مقالات در سایت درج می شوند ولی به دلیل عدم انتشار اصل مقاله، امکان ارائه آن وجود ندارد.

خرید و دانلود فایل PDF مقاله

متن کامل (فول تکست) این مقاله منتشر نشده و یا در سایت موجود نیست و امکان خرید آن فراهم نمی باشد

مشخصات نویسندگان مقاله An improved model of class C GPCR family member sweet taste receptor : construction and dynamics

  Elaheh Kashani-Amin - Biosensor Research Center, Endocrinology and Metabolism Molecular-Cellular Sciences Institute, Tehran University of Medical Sciences
  Amirhossein Sakhteman - Department of Medicinal Chemistry, School of Pharmacy, Shiraz University of Medical Sciences
  Bagher Larijani - Endocrinology and Metabolism Research Center, Endocrinology and Metabolism Clinical Sciences Institute, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran
  Azadeh Ebrahim-Habibi - Biosensor Research Center, Endocrinology and Metabolism Molecular-Cellular Sciences Institute, Tehran University of Medical Sciences

چکیده مقاله:

Sweet taste receptor, a heterodimer of T1R2 and T1R3 molecules, has not yet been experimentally observed. Molecular modeling techniques play a critical role in understanding atomic details of ligand binding or mechanism of action as a single receptor for various chemical structures. In recent years, several models of the individual domains or whole structure of the receptor have been provided. In this study, an enhanced model of sweet taste receptor is introduced. VFTM, CR and TMD were constructed separately. Quality of each model was evaluated by 60 ns of MD simulation in three iterations. Details of dynamics, secondary structure changes and orthosteric ligand binding site characteristics were investigated via interactions with experimentally known ligands, e.g. aspartame, or analysis of the reported key residues during simulation time. We showed that individually construction of the VFTM and CR domains improves quality of the model. However, further formation of a conserved disulfide bond between two distant cysteines in VFTM and CR domains affects structural dynamics and secondary structure in both monomers. These effects were discussed by 50 ns simulation in two iterations for both T1R2 and T1R3. We also showed that this bond has no significant effect on compactness of the orthosteric binding pockets.

کلیدواژه‌ها:

Sweet Taste Receptor; T1R2; T1R3; C GPCR; Homology Modeling; Ligand Docking

کد مقاله/لینک ثابت به این مقاله

برای لینک دهی به این مقاله، می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت مقاله در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:
https://www.civilica.com/Paper-IBIS07-IBIS07_094.html
کد COI مقاله: IBIS07_094

نحوه استناد به مقاله:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
Kashani-Amin, Elaheh; Amirhossein Sakhteman; Bagher Larijani & Azadeh Ebrahim-Habibi, ۱۳۹۶, An improved model of class C GPCR family member sweet taste receptor : construction and dynamics, هفتمین همایش بیوانفورماتیک ایران, تهران, انجمن بیوانفورماتیک ایران - دانشگاه تربیت مدرس, https://www.civilica.com/Paper-IBIS07-IBIS07_094.html

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این مقاله اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (Kashani-Amin, Elaheh; Amirhossein Sakhteman; Bagher Larijani & Azadeh Ebrahim-Habibi, ۱۳۹۶)
برای بار دوم به بعد: (Kashani-Amin; Sakhteman; Larijani & Ebrahim-Habibi, ۱۳۹۶)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

علم سنجی و رتبه بندی مقاله

مشخصات مرکز تولید کننده این مقاله به صورت زیر است:
نوع مرکز: علوم پزشکی
تعداد مقالات: ۳۸۰۹
در بخش علم سنجی پایگاه سیویلیکا می توانید رتبه بندی علمی مراکز دانشگاهی و پژوهشی کشور را بر اساس آمار مقالات نمایه شده مشاهده نمایید.

مدیریت اطلاعات پژوهشی

اطلاعات استنادی این مقاله را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

مقالات مرتبط جدید

شبکه تبلیغات علمی کشور

به اشتراک گذاری این صفحه

اطلاعات بیشتر درباره COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.