CIVILICA We Respect the Science
ناشر تخصصی کنفرانسهای ایران
عنوان
مقاله

High throughput deep sequencing revealed different molecular mechanisms in cereals are mediated by miRNAs

اعتبار موردنیاز : ۰ | تعداد صفحات: ۱ | تعداد نمایش خلاصه: ۴۳ | نظرات: ۰
سال انتشار: ۱۳۹۷
کد COI مقاله: IBIS08_046
زبان مقاله: انگلیسی
نسخه کامل مقاله در کنفرانس ارائه نشده است و در دسترس نیست.

مشخصات نویسندگان مقاله High throughput deep sequencing revealed different molecular mechanisms in cereals are mediated by miRNAs

  بهنام بخشی - 1بخش تحقیقات زراعی و باغی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی سیستان، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، زابل، ایران
  احسان محسنی فرد - 2گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، زنجان
قاسم حسینی سالکده - 3گروه زیست شناسی سامانه ها، پژوهشگاه بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران
    محمدرضا بی همتا - 4گروه اصلاح نباتات، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران

چکیده مقاله:

In the current study cereal (including wheat, barley and rice) miRNAs have been investigated using small RNA extraction, high throughput deep sequencing and bioinformatics analysis. In this study 28175274, 28404511 and 27515162 miRNA reads have been observed for wheat, barley and rice, respectively. 53%, 60% and 76% of these reads were matched with their genomes, respectively.1814 reads of known miRNAs and 105 reads of novel miRNAs have been identified for wheat. Likewise, 782 reads of known miRNAs and 131 reads of novel miRNAs have been explored for barley. Furthermore, 338 reads of known miRNAs and 31 reads of novel miRNAs have been recognized for barley. MiR156 and Novel_1290 (in wheat), miR168 and Novel_1290 (in barley) and miR166 and Novel_1290 (in rice) were the most frequent miRNAs in the investigated cereals. Thus different frequent miRNAs are involved in cereals. Furthermore, differential expression of cereal miRNAs has been observed for many of expressed miRNAs. Additionally, target prediction and gene ontology analysis indicated that although some of miRNAs are involved in same pathways among cereals but could regulate them through another ways that could led to different molecular mechanisms through differentially expressed miRNAs.

کلیدواژه‌ها:

microRNAs, Next Generation sequencing, Wheat, Barley, Rice

کد مقاله/لینک ثابت به این مقاله

برای لینک دهی به این مقاله، می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت مقاله در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:
https://www.civilica.com/Paper-IBIS08-IBIS08_046.html
کد COI مقاله: IBIS08_046

نحوه استناد به مقاله:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
بخشی, بهنام; احسان محسنی فرد; قاسم حسینی سالکده & محمدرضا بی همتا, ۱۳۹۷, High throughput deep sequencing revealed different molecular mechanisms in cereals are mediated by miRNAs, هشتمین همایش بیوانفورماتیک ایران, زابل, دانشگاه زابل- انجمن بیوانفورماتیک ایران, https://www.civilica.com/Paper-IBIS08-IBIS08_046.html

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این مقاله اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (بخشی, بهنام; احسان محسنی فرد; قاسم حسینی سالکده & محمدرضا بی همتا, ۱۳۹۷)
برای بار دوم به بعد: (بخشی; محسنی فرد; حسینی سالکده & بی همتا, ۱۳۹۷)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

علم سنجی و رتبه بندی مقاله

مشخصات مرکز تولید کننده این مقاله به صورت زیر است:
نوع مرکز: سازمان تحقیقات کشاورزی
تعداد مقالات: ۱۸۱
در بخش علم سنجی پایگاه سیویلیکا می توانید رتبه بندی علمی مراکز دانشگاهی و پژوهشی کشور را بر اساس آمار مقالات نمایه شده مشاهده نمایید.

مدیریت اطلاعات پژوهشی

اطلاعات استنادی این مقاله را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

مقالات مرتبط جدید

شبکه تبلیغات علمی کشور

به اشتراک گذاری این صفحه

اطلاعات بیشتر درباره COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.