تصحیح کمترین خطا در بازسازی هاپلوتایپ با یک الگوریتم سریع
محل انتشار: چهاردهمین کنفرانس مهندسی پزشکی ایران
سال انتشار: 1386
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,496
فایل این مقاله در 8 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
ICBME14_044
تاریخ نمایه سازی: 3 تیر 1387
چکیده مقاله:
یکی از مدلهای مهم مساله بازسازی هاپلوتایپ تصحیح کمترین غلط می باشد. این مدل با تصحیح کمترین غلط ممکن در قطعات ژنوم ورودی، جفت هاپلوتایپ را بازسازی می نماید. با توجه به این که این مساله جزء مسائل غیر قطعی سخت (NP-Hard) می باشد، الگوریتهای قبلی ارائه شده با دو مشکل هزینه زیاد زمان اجراء و عدم جواب قطعی روبرو هستند. در این مقاله برای حل این مساله یک الگوریتم شاخه و قید ارائه شده است که با استفاده از یک تابع هرس جدید میتواند مساله را در یک زمان مناسب بطور دقیق اجرا نماید. این الگوریتم بر روی یک مجموعه داده اجرا شده و زمان اجرای آن کارا بودن آن را نشان می دهد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
مهدی صادقی
پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری ، تهران
هایده اهرابیان
گروه علوم کامپیوتر، دانشکده ریاضی، آمار و علوم کامپیوتر ، دانشگاه ته
عباس نوذری
گروه علوم کامپیوتر، دانشکده ریاضی، آمار و علوم کامپیوتر ، دانشگاه ته
جواد محمدزاده
گروه علوم کامپیوتر، دانشکده ریاضی، آمار و علوم کامپیوتر ، دانشگاه ته
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :