ارایه فیلتر جدید بهبود لکه های پروتئینی در تصاویر الکتروفورز دو بعدی

سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,197

فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

ICEE21_567

تاریخ نمایه سازی: 27 مرداد 1392

چکیده مقاله:

الکتروفورز ژل دو بعدی یکی از روشهای پایه ای در علم پروتئومیک است. در این روش با جداسازی پروتئینهای موجود در نمونه اولیه بر اساس دو ویژگی وزن مولوکولی و بار الکتریکی در دو بعد، پروتئینها از هم جدا شده و تصویری متشکل از لکه هایی پروتئین شکل می گیرد. ازدیدگاه پردازش تصویر این تصاویر دارای پیچیدگیهای فراوانی هستند. با توجه به وجود تعداد بسیار زیاد لکه های پروتئینی در یک ژل نمونه، وضرورت جداسازی و تشخیص هریک از لکه های پروتئینی و از سویی دیگر وجود منابع نویز و آرتیفکت های گوناگون در این تصاویر پردازش این تصاویر با چالشهای متعددی مواجه است. در این پژوهش فیلتری نوین بر پایه ویژگیهای مکانی هندسی، مشتقات مرتبه دوم و مقادیر ویژهی Hessianتصویر، جهت بهبود لکه های پروتئینی ارایه شده است. این فیلتر می تواند به عنوان یک مرحله پیش پردازش در پردازش تصاویرالکتروفورز ژل دو بعدی بکار گرفته شود. نتایج ارایه شده در این تحقیق، نشان دهنده عملکرد مناسب فیلتر ارایه شده در بهبود تصاویرالکتروفورز ژل دو بعدی و کاهش منابع نویز و آرتیفکتهای موجود می باشد

کلیدواژه ها:

الکتروفورز ژل دو بعدی ، تشخیص لکه ، پروتئین ، فیلتر

نویسندگان

سینا شامخی

دانشجوی دکتری مهندسی پزشکی، دانشکده مهندسی برق و کامپیوتر، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران،

محمدحسین میران بیگی

دانشیار دانشکده مهندسی برق و کامپیوتر، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران

علی گویا

استادیار دانشکده مهندسی برق و کامپیوتر، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران