Multiple sequenc e alignment using biological features classification
سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 782
فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
ICKIS01_035
تاریخ نمایه سازی: 25 فروردین 1394
چکیده مقاله:
Multiple biological sequences alignment like protein sequences or DNA/RNA in order to discover the functions, structures and evolutionary relationships among species andalso discovering drugs is a fundamental study in bioinformatics. Unfortunately the multiple sequence alignment is a NP-completeproblem and the reliability of the existing algorithms is not so high. The objective of our study was to improve multiple sequence alignment using biological features such as secondary structure of the sequences available in knowledge databases like SWISSPROT to achieve a more reliable alignment. We alsoprovide a new method for grouping the similar sequences using biological features. The results of our tests on these databasesindicate that the accuracy of the provided FCB MSA algorithm is much more than the existing alignment tools such as TCOFFEEand MAFFT.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
Arezoo besharati
Imam Reza International University Mashhad, Iran
Mehrdad jalali
Faculty member of Islamic Azad university, Mashhad branch Mashhad, Iran
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :