ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

تعیین نوازی اکسون در توالی DNA باعث مدل ترکیبی فیلتر معکوس میان گذر تیز و الگوریتم گورتزل

محل انتشار: هشتمین کنفرانس ماشین بینایی و پردازش تصویر ایران
سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,201

فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/227435

شناسه ملی سند علمی:

ICMVIP08_085

تاریخ نمایه سازی: 9 بهمن 1392

چکیده مقاله:

در این مقاله یک الگوریتم به سینه بر مبنای مدل ترکیبی فیلتر معکوس میان گذر تیز و الگوریتم گورتزل به منظور تأمین نواحی کد کننده پروتئین در توالی DNA ارائه است. از فیلتر معکوس میان گذر شیست به منظور حذف نویز فرکانس بالا برده بود به عدد تخمین نواحی ژنی استفاده شده است. همچنین به منظور استخراج مؤلف تناوب - 3 در توالی DNA از گروه گورتزل استفاده می‌نماییم. الگوریتم پیشنهادی برروی ژن F56F11.4 واقع در کروموزوم سوم از C.elegans اعمال و نتایج آن با سایر روش‌های موجود مقایسه است. نتایج پیاده‌سازی نشان می‌دهد که الگوریتم پیشنهادی از عملکرد بسیار خوبی در تأمین نواحی کد کننده پروتئین و خصوصاً در تعیین ژنی با ابعاد کوچک برخوردار است.

کلیدواژه ها:

نواحی کد کننده پروتئین ، تناسب - 3 ، DNA فیلتر معکوس میان گذر تیز ، گورتزل ، اکسون

نویسندگان

حمیدرضا صابر کاری

دانشکده مهندسی برق - دانشگاه صنعتی سهند تبریز

موسی شمسی

دانشکده مهندسی برق - دانشگاه صنعتی سهند تبریز

محمدحسین صداقی

دانشکده مهندسی برق - دانشگاه صنعتی سهند تبریز

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • صابرکاری ح.، شمسی م.، صداقی م. ح.، شناسایی مکان نواحی ...
  • Dougherty E. R, et al., Genomic signal processing and statistics, ...
  • P .P .Vaidyanathan, and B.J.Yoon, _ role of signal processing ...
  • periodicities complete genome reflect protein structure and DNA folding, " ...
  • X.F.Wan, D.Xu, A.Kleinhofs, and J.Zhou, "Quantitative relationship between synonymous codon ...
  • H.Herzel, E. N.Trifonov, O.Weiss, and I.GroBe, "Interpreting correlations in bio ...
  • Vol. 85, pp. 1342-1345, 1992. ...
  • Henderson, J., et al., "Finding genes in DNA with a ...
  • Ding, C. H., and Dubchak, I., "Multi-class protein fold recognition ...
  • Anastassiou, D., "Genomic signal processing, " IEEE Sign. Proc. Mag, ...
  • Fox, T. W., and Carreira, A., "A digital signal processing ...
  • Tiwari S., Ramachandran S., Bhattacharya A., Bhattacharya S., and Ramaswamy ...
  • sequences, " Comput Appl Biosci, Vol. 13, pp. 263-270, ...
  • Saberkari H., Shamsi M., Sedaghi M. H., "Prediction of protein ...
  • Bandung, Indonesia, pp. 354-359, September 2012. ...
  • Datta S., Asif A., "A Fast DFT-Based Gene Prediction Algorithm ...
  • _ of the so" International _ Acoustics, Speech, and Signal ...
  • Akhtar M., Epps J., Ambikairajah E., "Signal Processing in sequence ...
  • J. Ning, C. N. Moore, and J. C. Nelson, "Preliminary ...
  • P. P. Vaidyanathan, and B. J. Yoon, "Gene and exon ...
  • A.V. Oppenheim, and R.W.Schafer, Discrete Time Signal Processing, Prentice Hall, ...
  • National Center for Biotechnology Information, National Institutes of Health, National ...
    • نمایش کامل مراجع