استنتاج و یادگیری شبکههای تنظیمی ژنتیکی بیزی توسط الگوریتم تکاملی

سال انتشار: 1394
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 355

فایل این مقاله در 18 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

ICOAC01_072

تاریخ نمایه سازی: 9 مرداد 1395

چکیده مقاله:

تعاملات بین ژنها، پروتئینها و مواد دیگر در سلول تشکیل یک شبکه پیچیده به نام شبکه تنظیمی ژن را میدهند؛ که نقش مهمی در عملکرد سلول ایفا میکند . استنتاج این شبکهها از دادههای بیان ژن، یکی از مسئلههایکلیدی و مهم در سامانههای زیستی محاسباتی است که در حال حاضر بسیاری از دانشمندان به آن می پردازند . روشهای مختلفی برای استنتاج شبکه تنظیمی ژن از دادههای میکروآرایه پیشنهاد شده است، از میان روشهایارائه شده، شبکههای بیزی به دلیل خصوصیاتی که دارا میباشند، یک مدل مناسب برای استنتاج شبکه تنظیمی ژن به شمار میآیند . الگوریتمهای مختلفی برای یادگیری شبکههای بیزی پیشنهاد شده است، که از میان آنها میتوان به الگوریتمPC و k2 نیز اشاره کرد. در اینجا به بررسی این الگوریتمها بر روی شبکهALARM وASIAوهمچنینDREAM پرداخته شده است؛ و علاوه بر آن نتایج استنتاج شبکهها توسط الگوریتم تکاملی نیز ارائه شده است

کلیدواژه ها:

استنتاج شبکههای تنظیمی ژن ، شبکههای بیزی ، الگوریتم تکاملی

نویسندگان

فاطمه زهرا گهربخش

دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات ساوه، دانشکده فنی و مهندسی، گروه مهندسی کامپیوتر

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • N. Friedman, M. Linial, I. Nachman and D. Pe'er, Using ...
  • A. Djebbari, and J. Quackenbush, Seeded Bayesian Networks: constructing genetic ...
  • S.Imoto , T. Higuchi , T. Goto , K. Tashiro ...
  • A.V. Werhli , D. Husmeier , Reconstructing gene regulatoru networks ...
  • S.Y. Kim, S. Imoto, S. Miyano, Inferring gne networks from ...
  • G.F. Cooper and E. Herskovits, A Bayesian method for the ...
  • S. Kauffman, Metabolic stability and epigenesis in randomly constructed genetic ...
  • A.A. Margolin, I. Nememman, K. Basso, C. Wiggins, G. Stolovitzky, ...
  • L. Kaderali and N. Radde, Inferring Gene Regulatory Networks from ...
  • G.F. Cooper and E. Herskovits, A Bayesian method for the ...
  • M. J. Beal, F. Falciani, Z. Ghahramani, C. Rangel and ...
  • Shin Ando, Hitoshi Iba, inference of gene regulatory Model by ...
  • Z. Li, P. Li, A. Krishnan and , Liu, large ...
  • Y. Li, L. Liu, X. Bai, H. Cai, W. Ji, ...
  • D.Koller N.Friedman, probabilistic graphical models: principles and techniques, MIT press2010 ...
  • Rosa Aghdam and et al , IPCA-CMI: An algorithm for ...
  • نمایش کامل مراجع