فناوری RNA-SEQ و کاربرد آن در زیست شناسی اامیست های بیمارگر گیاهی

توالی یابی آرانای، معروف به RNA-SEQ که به توالی یابی شاتگانی کل ترانسکریپتوم نیز معروف است، نوعی فناوریاست که با بهره گیری از توانایی های توالی یابی نسل بعدی برای به دست آوردن تصویری کلی از حضور و مقدار آرانای ازژنوم در یک بازهی زمانی خاص استفاده می کند. ترانسکریپتوم یک سلول به میزان زیادی متغیر است و در طول زمان نیزتغییر می کند، در صورتی که اگر از جهش ها چشمپوشی کنیم، ژنوم سلول همواره ثابت و بدون تغییر باقی میماند.پیشرفت های اخیر در توالی یابی نسل بعدی باعث شده که بازه ی پوشش توالی یابی نوکلئوتیدها و همچنین مقدار نمونه یورودی برای توالی یابی افزایش پیدا کند. این پیشرفت ها، توالی یابی ترانوشت های آرانای سلول را تسهیل می کند و به مااین امکان را میدهد که ترانوشت های برش خورده ی ژن، تغییرات پس از ترانویسی، هم جوشی ژن ها، جهش ها وچندشکلی تکنوکلئوتیدی و در نهایت تغییرات در بیان ژن را بررسی کنیم. در سال های اخیر، واکاوی ترانسکریپتوم بهعنوان یکی از مراحل بنیادی در مطالعات زیست شناختی مطرح شده است. مطالعات انجام گرفته با این فناوری، دیدگاه مارا نسبت به وسعت و پیچیدگی ترانوشت های موجود در سلول های یوکاریوتی، عوض کرده است. همچنین این روشنسبت به سایر روشها، اندازه گیری دقیق تری از سطوح ترانوشت ها و فرم های مشابه آنها را فراهم می سازد. این مقالهرهیافت RNA-SEQ را توصیف کرده، چالش های مرتبط با کاربرد آن را در مطالعات زیست شناختی اامیست های بیمارگرگیاهی مطرح می کند و پیشرفت های حاصل در شناسایی چندین ترانسکریپتوم یوکاریوتی را نیز نشان میدهد.

کلیدواژه ها:

توالی یابی نسل بعدی ، بیان ژن ، ترانسکریپتوم ، اامیست