روش ترکیبی انتخاب ژن برای دسته بندی ریزآرایه داده بیان ژن

مطالعات اخیر نشان میدهد، ریزآرایه داده بیان ژن برای دسته بندی تعداد زیادی از بیماری ها مفید می باشد. چالشاصلی در دسته بندی مساله مورد نظر، این است که عدم تقارن شدید در تعداد ژنها و نمونه ها وجود دارد. انتخابمجموعه کوچکی از ژن هایی که دارای بار اطلاعاتی هستند موجب بهبود دقت دسته بندی می شود. متدهای اخیر بااستفاده از محاسبات آماری و آنتولوژی ژن سعی دارند تعداد ژنها را کاهش دهند. در این مقاله روشی ارائه گردیدهاست که علاوه بر در نظر گرفتن ارتباط زیستی میان ژنها، ژن های افزونه را با استفاده از خوشه بندی سلسله مراتبیحذف میکند و موجب بهبود دقت دسته بندی می گردد. ساختار و عملکرد این روش به صورت جزئی در متن مقاله مطرحشده است. آزمایش ها با استفاده از یک مجموعه داده واقعی نشان می دهند روش پیشنهادی در مقایسه با روشی کهاز شباهت معنایی استفاده میکند، علاوه بر انتخاب تعداد ژن های کمتر دارای دقت دسته بندی (Loocv) بیشتری می باشد.

کلیدواژه ها:

آنتولوژی ، انتخاب ژن ، شباهت معنایی ، دسته بندی داده بیان ژن