CIVILICA We Respect the Science
(ناشر تخصصی کنفرانسهای کشور / شماره مجوز انتشارات از وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی: ۸۹۷۱)
عنوان
مقاله

آنالیز بیان ژن های سلول با استفاده از Support Vector Machines

اعتبار موردنیاز: ۱ | تعداد صفحات: ۱۱ | تعداد نمایش خلاصه: ۱۹۳۴ | نظرات: ۰
سال انتشار: ۱۳۸۶
کد COI مقاله: IDMC01_041
زبان مقاله: فارسی
فایل PDF حاوی متن کامل این مقاله در حال حاضر در سایت موجود نمی‌باشد.

راهنمای دانلود فایل کامل این مقاله

متن کامل این مقاله منتشر نشده و درپایگاه سیویلیکا موجود نمی باشد.

منبع مقالات سیویلیکا دبیرخانه کنفرانسها است. برخی از دبیرخانه ها اقدام به انتشار اصل مقاله نمی نمایند. به منظور تکمیل بانک مقالات موجود، چکیده این مقالات در سایت درج می شوند ولی به دلیل عدم انتشار اصل مقاله، امکان ارائه آن وجود ندارد.

خرید و دانلود PDF مقاله

اصل مقاله (فول تکست) فوق منتشر نشده و یا در سایت موجود نیست و امکان خرید آن فراهم نمی باشد

مشخصات نویسندگان مقاله آنالیز بیان ژن های سلول با استفاده از Support Vector Machines

  امیرحسین اسدی (شناسه پژوهشگر - Researcher ID: ۶۶۵۲)
دکتری ریاضیات، دانشگاه ویسکانسین - مدیسون، آمریکا
  حسام الدین ترابی دشتی - دانشجوی مقطع کارشناسی ارشد علوم کامپیوتر، دانشگاه تهران
  نسیم جمالی - مهندسی نرمافزار، مرکز عالی بیوماتمتیک، دانشگاه تهران

چکیده مقاله:

آنالیز رفتار سلول های موجودات زنده به منظور ادراک فرآیندهای حیاتی سلول یکی از مهم ترین مسائل مطرح در زمینه تحقیقاتی بیوانفورماتیک به شمار میرود . از آنجا که رفتارهای گوناگون سلول از طریق تغییر مقدار کپیبرداری از ژن هایش - که به آن بیان ژن میگویی صورت می پذیرد، آنالیز رفتار سلول از طریق بررسی بیان ژن های سلول صورت میگیرد در مورد تغییر مقدار بیان ژن، نکته حائز اهمیت، تأثیر تغییر بیان یک ژن بر مقدار بیان سایر ژن هاست . تحقیقات زیست - شناسان در این زمینه، نشان داده است که این تأثیر به صورت گروهی صورت میپذیرد . این بدان معنی است که تغییر بیان دسته ای از ژن ها باعث تغییر بیان ژن دسته یا دستههای دیگری از ژن ها میگردد . این تأثیرات به صورت سلسله مراتبی به سایر دسته ژن ها ] ٤ ۵۱ [ نیز منتقل میگردد . به عنوان مثال افزایش ( کاهش ) مقدار بیان ژن های دسته A باعث افزایش ( کاهش ) مقدار بیان ژن های دسته B میگردد؛ که این تغییر، خود بر مقدار بیان ژن های دسته C میتواند تأثیر گذار باشد و این سلسله تأثیرگذاری ها ادامه پیدا میکند . این مثال بیانگر درجه ی اهمیت تشخیص گروه ژن های تأثیر گذار بر یکدیگر در آنالیز رفتار سلول میباشد . گروه بندی ٥ ژن هایی که تأثیر یکسان بر سایر ژن ها دارند یا به عبارت دیگر هم رفتاراند، از طریق بررسی مکاشفهای میزان تغییر بیان هر یک از ژن ها صورت میگیرد . از آنجا که تأثیر بیان ژن ها بر یکدیگر نیازمند گذر زمان است،
بررسی تغییر بیان ژن ها بر یکدیگر، نیازمند آنالیز یک سری زمانی از مقدار بیان ژن ها می باشد . متد محاسباتی ارائه شده در این مقاله بر پایه Support Vector Machines به گروه بندی ژن های هم رفتار میپردازد . این متد بر روی پایگاه دادهای از مقدار بیان ۰۰۰۷۲ ژن در۳ حالت مختلف سلول که از ۱۱ مورد اندازه گیری بیان ژن ها به دست - آمده، آزمایش گردید . بیان ژن ها از سلول های مبتلا به بیماری پارکینسون جمع آوری شده است و سه حالت فوق مربوط به سلول سالم، سلول بیماری که داروی پرگولاید ٦ روی آن آزمایش گردیده و حالت آخر مربوط به زمانی است که دارو های پرگولاید و کینسترین ٧ بر روی بدن بیمار آزمایش گردیده اند . نتایج بدست آمده از این تحقیق نشان میدهد که الگوریتم طراحی شده، ۸۹ % گروهبندی زیست شناسان ‐ که بر پایه اطلاعات آزمایشگاهی میباشد - را به درستی تشخیص داده و همچنین گروه بندیهای جدید و سلسله مراتبهای جدیدی را نیز استخراج نموده است

کلیدواژه‌ها:

گروه بندی، بیان ژن ها، مسیر تأثیرگذاری ژن ها ، Support Vector Machine

کد مقاله/لینک ثابت به این مقاله

برای لینک دهی به این مقاله، می توانید از لینک زیر استفاده نمایید. این لینک همیشه ثابت است و به عنوان سند ثبت مقاله در مرجع سیویلیکا مورد استفاده قرار میگیرد:
https://www.civilica.com/Paper-IDMC01-IDMC01_041.html
کد COI مقاله: IDMC01_041

نحوه استناد به مقاله:

در صورتی که می خواهید در اثر پژوهشی خود به این مقاله ارجاع دهید، به سادگی می توانید از عبارت زیر در بخش منابع و مراجع استفاده نمایید:
اسدی, امیرحسین؛ حسام الدین ترابی دشتی و نسیم جمالی، ۱۳۸۶، آنالیز بیان ژن های سلول با استفاده از Support Vector Machines، اولین کنفرانس داده کاوی ایران، تهران، دانشگاه صنعتی امیرکبیر، موسسه پژوهشی داده پردازان گیتا، https://www.civilica.com/Paper-IDMC01-IDMC01_041.html

در داخل متن نیز هر جا که به عبارت و یا دستاوردی از این مقاله اشاره شود پس از ذکر مطلب، در داخل پارانتز، مشخصات زیر نوشته می شود.
برای بار اول: (اسدی, امیرحسین؛ حسام الدین ترابی دشتی و نسیم جمالی، ۱۳۸۶)
برای بار دوم به بعد: (اسدی؛ ترابی دشتی و جمالی، ۱۳۸۶)
برای آشنایی کامل با نحوه مرجع نویسی لطفا بخش راهنمای سیویلیکا (مرجع دهی) را ملاحظه نمایید.

مدیریت اطلاعات پژوهشی

اطلاعات استنادی این مقاله را به نرم افزارهای مدیریت اطلاعات علمی و استنادی ارسال نمایید و در تحقیقات خود از آن استفاده نمایید.

مقالات مرتبط جدید

شبکه تبلیغات علمی کشور

به اشتراک گذاری این صفحه

اطلاعات بیشتر درباره COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.