بررسى ژنوتیپ ویروس بیمارى نیوکاسل دخیل در سه گله گوشتى شهرستان گرمسار با استفاده از سکانس ژن F

یکى از شایع ترین بیمارى ها در صنعت طیور نیوکاسل مى باشد. در ایران بیماری نیوکاسل برای اولین بار در سال 1329 به طور دقیق و آزمایشگاهی تشخیص داده شد. از این رو بیماری طی مدت کوتاهی در سایر استان های کشور شیوع یافت و به خوبی در ایران مستقر گردید. به طوری که از آن هنگام تاکنون این بیماری یکی از مهم ترین آفات صنعت طیور کشور به شمار می آید. روش کار: طى بررسى هاى صورت گرفته، اقدام به اخذ نمونه سوآب از سه گله که سابقه درگیرى با ویروس نیوکاسل را داشته اند، گردید. بعد از ارسال نمونه ها با آزمایشگاه و تایید حضور ویروس نیوکاسل محصول PCR خالص شده و به منظور تعیین توالى به صورت دو طرفه به آزمایشگاه Bioneer کره جنوبى ارسال شد. تعیین توالى توسط Kit Reaction Ready sequencing Cycle Terminator BigDye Prism ABI و به روش اتوماتیک انجام گرفت. بحث و نتیجه گیرى: یکى از راه هاى تعین حدت جدایه هاى ویروس نیوکاسل، بررسى ژن F در ناحیه شکافت مى باشد (0Fتبدیل به 1F و 2.( F طى بررسى هاى انجام شده در این تحقیق، با استفاده از پرایمر هاى اختصاصى ژن F توسط PCR-RT از دو گله ویروس virulent نیوکاسل جدا گردید. جدایه ها بر اساس توالى و تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک بخشى از ژن F توسط PCR-RT مورد بررسى قرار گرفتند. آنالیز فیلوژنتیک با استفاده از برنامه MEGA و رسم درخت فیلوژنى با هزار بار تکرار جهت صحت درخت فیلوژنى، انجام شد. نتایج آنالیز فیلوژنتیک نیز نشان مى دهد که جدایه جدا گردیده عامل بیمارى نیوکاسل در فارم هاى گوشتى شهرستان گرمسار، ژنوتیپ VIId مى باشد که توالى آنتى ژنى ژن F در جایگاه 112 تا 116 توالى RRQKR (آرژنین، آرژنین، گلوتامین، لیزین، آرژنین)و در جایگاه 117 شاهد حضور F (فنیل آلانین) مى باشیم.

کلیدواژه ها:

ژنوتیپ ، نیوکاسل ، PC