بررسی ارتباط بین تعدادی از صفات فیزیولوژیک و مرفولوژیک کلزا با نشانگرهای مولکولی SSR در شرایط تنش خشکی

سال انتشار: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 415

فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_ESCS-12-4_003

تاریخ نمایه سازی: 9 تیر 1399

چکیده مقاله:

به منظور شناسایی نشانگرهای آگاهی بخش مرتبط با تعدادی صفات و شاخص های فیزیولوژیک 22 ژنوتیپ کلزا تحت شرایط تنش خشکی، از 36 نشانگر ریزماهواره ای که با QTL های کنترل کننده صفات مرفولوژیک در شرایط تنش خشکی پیوسته بودند، استفاده شد. به منظور شناسایی نواحی ژنومی دخیل در کنترل صفات فیزیولوژیک از مد ل های ارتباطی GLM و MLM استفاده شد. میزان محتوای اطلاعات چندشکلی در بین نشانگرها از 0.043 (CB10502) تا 0.398 (CB10234) متغیر بود. متوسط میزان شاخص PIC برابر با 0.212 بود. بر اساس 36 نشانگر ریزماهواره ای مورد استفاده در این تحقیق، ساختار ژنتیکی جمعیت به 8 زیر جمعیت فرعی تقسیم گردید که نتایج حاصل از رسم بارپلات نیز تایید کننده آن بود. در تجزیه ارتباط با استفاده از مدل های GLM و MLM به ترتیب 6 و 16 مکان نشانگری معنی دار در شرایط بدون تنش با صفات مورد بررسی شناسایی شد. در شرایط تنش خشکی، با استفاده از مدل های GLM و MLM به ترتیب 42 و 46 مکان نشانگری مرتبط با صفات مورد بررسی مشخص شد. در این مطالعه، نشانگرهای BRMS-036، SR94102، BRAS100، CB1059b، BRMS-024، BRMS-096، BRMS-30، MR013c و Pmr52 بیش ترین ارتباط معنی دار را با صفات فیزیولوژیکی در شرایط تنش خشکی داشتند. بنابراین این احتمال وجود دارد که این نشانگرها بتوانند کاندیدای بسیار مناسب و امیدوار کننده در برنامه های به نژادی تحمل به تنش خشکی مثل انتخاب به کمک نشانگر در کلزا باشد.

کلیدواژه ها:

تجزیه ارتباط ، تنش خشکی ، مدل های GLM و MLM

نویسندگان

حسن زالی

استادیار، بخش تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی فارس، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، داراب

امید سفالیان

دانشیار، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشگاه محقق اردبیلی، اردبیل

طاهره حسنلو

استادیار، بخش فیزیولوژی مولکولی، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج

مهرشاد زین العابدینی

استادیار، بخش ژنومیکس، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Anderson, J.A., Churchill, G.A., Autrique, J.E., Tanksley, S.D., Sorrells, M.E., ...
  • Arnon, D.I., 1949. Copper enzymes in isolated chloroplasts. Polyphenoloxidase in ...
  • Ashraf, M., Mehood, S., 1990. Response of four Brassica species ...
  • Evanno, G., Regnaut, S., Goudet, J., 2005. Detecting the number ...
  • Dellaporta, S.L., Wood, J., Hicks, J.B., 1983. A plant DNA ...
  • Donini, P., Stephenson, P., Bryan, G.Y., Kobner, R.M.D., 1998. The ...
  • Flakelar, C.L., Luckett, D.J., Howitt, J.A., Dorana, G., Prenzler, P.D., ...
  • Ghanbari, A.A., Mousavi, S.H., MousapourGorji, A., Rao, I., 2013. Effect ...
  • Gupta, P.K., Rustgi, S., Kulwal, P.L., 2005. Linkage disequilibrium and ...
  • Hardy, O.J., Vekemans, X. 2002. Spagedi: a versatile computer program ...
  • Hasan, M., Friedt, W., Pons-Kühnemann, J., Freitag, N.M., Link, K., ...
  • Honsdorf, N., Becker, H.C., Ecke, W., 2010. Association mapping for ...
  • Jannink J.L., Walsh, B., 2002. Association mapping in plant populations. ...
  • Jun, Z., Congcong, J., Zhengying, C., Ruiyuan, L., Yan, L., ...
  • Kimber, D.S., Mc Gregor, D.I., 1995. The species and their ...
  • Li, Z., Mei, Sh., Mei, Zh., Liu, X., Fu, T., ...
  • Lou, Y., Hu, L., Chen, L., Sun, X., Yang, Y., ...
  • Mantel, N.A., 1967. The detection of disease clustering and a ...
  • Moghaieb, R.E.A., Mohammed, F.H.K., Youssief, S.S., 2014. Genetic diversity among ...
  • Mohammadi, S.A., Prasanna, B. M. Cudan, C., Singh, N.N., 2002. ...
  • Moradi, F., Esmaeilzadeh Moghadam, M., Zali, H., 2016. Production and ...
  • Nakao Kubo, M.H., 2008. Development and characterization of simple sequence ...
  • Neale, D.B., Savolainen, O., 2004. Association genetic of complex traits ...
  • Piquemal, J., Cinquin, E., Couton, F., Rondeau, C., Seignoret, E., ...
  • Powell, W., Morgante, M., Ander, C., Hanafey, M., Vogel, J., ...
  • Qu, C., Hasan, M., Lu, K., Liu, L., Liu, X., ...
  • Rampino, P., Pataleo, S., Gerardi, C., Mita, J., Perrotta, C., ...
  • Semgan, K., 2002. Genetic relationships among ten endod types as ...
  • Sheligl, H.Q., 1986. Die verwertung orgngischer souren durch chlorella lincht ...
  • Singh, S.P., Diwivedi. V.K., 2002. Character association and path analysis ...
  • Slama, I., Ghnaya, T., Hessini, K., Messedi, D., Savoure, A., ...
  • Tabkhkar, N., Rabiei, B., Samizadeh Lahiji, H., Hosseini Chaleshtori, M. ...
  • Tondelli, A., Xu, X., Moragues, M., Sharma, R., Schnaithmann, F., ...
  • Yu, J,, Pressoir, G., Briggs, W.H., Vroh Bi, I., Yamasaki, ...
  • Zada, M., Zakir, N. Rabbani, M.A. Shinwari, Z.K., 2013. Assessment ...
  • Zali, H., Sofalian, O., Hasanloo, T., Asgharii, A., Zeinalabedini, M., ...
  • Zali, H., Sofalian, O., Hasanloo, T., Asgharii, A., Zeinalabedini, M., ...
  • نمایش کامل مراجع