شناسایی و تعیین توالی ژن مربوط به آنتی پورتر هیدروژن/سدیم از غشای پلاسمای گیاه Kochia scoparia L.

یکی از راھکارھای گیاھان برای کاھش مقدار سدیم سیتوزولی، دفع سدیم به خارج سلول است. این دفع خارج سلولی، مانع از اثرھای سمی سدیم در فرآیندھای سلولی سیتوزول می شود. ناقل ھای سدیم/ھیدروژن غشای پلاسمایی (SOS1) یکی از بھترین پروتیین ھای درگیر در این فرآیند ھستند. در این پژوھش از گیاه دولپه و شورزی Kochia scoparia به عنوان منبع برای جداسازی ژن استفاده شد. بر ھمین اساس با استفاده از آغازگرھای طراحی شده در مناطق حفاظت شده در گیاھان دیگر، طول تقریبی 3600 نوکلیوتیدی و به تبعیت از آن توالی 1200 اسیدآمینه ای از توالی کدکننده این ژن شناسایی و تعیین توالی شد. میزان شباھت این توالی در سطح نوکلیوتیدی با حداکثر 84 درصد ھمولوژی و در سطح اسیدآمینه ای 92 درصد با استفاده از بررسی BLAST تایید شد. تجزیه و تحلیل ھای بعدی برای تعیین خصوصیات پروتیینی و ارتباط آن با پروتیین ھای دیگر با استفاده از مطالعات بیوانفورماتیک انجام شد و نتایج نشان داد که منطقه حاوی مارپیچ ھای آلفای آبگریز به عنوان قطعه گذرنده از غشای پلاسمایی است و در مقابل آن دنباله با تعداد کمتر مارپیچ ھای آلفای و خاصیت آبدوستی به عنوان قطعه داخل سلولی پروتیین می باشد. این نتایج نقش دفع سدیم توسط ناقل ھای غشای پلاسمایی را برای وجود واکنش مقاومت به شوری در گیاه کوشیا تایید نمود.

کلیدواژه ها:

جداسازی ژن ، شوری ، کوشیا ، ناقل های غشای پلاسمایی