The use of topological indices to predict thermodynamic properties of amino acids derivatives

سال انتشار: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 350

فایل این مقاله در 14 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_ICC-7-3_008

تاریخ نمایه سازی: 23 تیر 1398

چکیده مقاله:

In the present investigation the applicability of various topological indices are tested for the QSPR study on 80 amino acids derivatives. Relationship between the Randic (1X), Balaban (J), Szeged (Sz), Harary (H), Wiener (W), Hyper-Wiener (WW) and Wiener Polarity (WP) indices to the thermodynamic Properties such as thermal energy Eth (J/mol) and heat capacity (CV J/mol. K) of amino acids is represented. The thermodynamic properties are taken from HF level using the ab initio 6-31G basis sets from the program package Gaussian 98. We have used Multiple Linear Regression (MLR) techniques and followed back ward regression analysis for obtaining properties. By analyzing the correlation between the indices in suitable models, the most suitable indicators for modeling properties were determined. The predictive powers of the models were discussed using leave-one-out (LOO) cross-validation. The obtained results show that combining of the two descriptors (J, 1X) could be used successfully for modeling and predicting the heat capacity (CV), and thermal energy (Eth) of amino acids derivatives.

نویسندگان

Afsaneh Safari

Department of chemistry Arak Branch, Islamic Azad University

Fatemeh Shafiei

Department of Chemistry, Arak Branch, Islamic Azad University, P.O. Box ۳۸۱۳۵-۵۶۷, Arak, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • H.D. Jakube, H. Jeschkeit, Eine Einführung, Akademie-Verlag, Berlin., 1982, 26, ...
  • N. Ahmadinejad , M. Talebi Tari, J. Chem. Method., 2019, ...
  • M. Nabati , M. alsadat Kermanian, H. Mohammadnejad-Mehrabani, H. Rahbar ...
  • A.T. Balaban, T.S. Balaban, J. Math. Chem., 1991, 8, 383-397. ...
  • P.J. Hansen, P.C. Jurs, J. Chem. edu., 1988, 65, 574-580. ...
  • G. Rucker, C. Rucker, J. Chem. Inf. Comput. Sci., 1999, ...
  • M. Shahpar, S. Esmaeilpoor,   A. J.  Green Chem., 2017, 1, ...
  • Y.  Boukarai, F. Khalil, M. Bouachrine, J. Chem. Method., 2017, ...
  • M.P. Gonzales, A.M. Helguera, M.A. Cabrera, Bioorg. Med. Chem., 2005, ...
  • M. Randic , S.C. Basak, SAR. QSAR.  Environ. Res., 2000, ...
  • O. Ivanciuc, T. Ivanciuc, D. Cabrol-Bass, A.T. Balaban, J. Chem. ...
  • M.  Nabati, J. Chem. Method., 2017, 1, 121-135. ...
  • A.R. Katritzky, V.S. Lobanov, M. Karelson, Chem. Soc. Rev., 1995, 24, ...
  • A. R.Katritzky, U. Maran, V.S. Lobanov, M. Karelson, J. Chem. ...
  • Y.P. Du, Y.Z. Liang, B.Y. Li, C.J. Xu, J. Chem. ...
  • Z. Slanina, F. Uhlik, S.L. Lee, E. Osawa, MATCH Commun. ...
  • Yi. Gao, M.  Farahani, W.  Nazeer, J. Chem. Method., 2018, ...
  • A.T. Balaban, J. Chem. Inf. Comput. Sci., 1995, 35, 339-350. ...
  • M. Randić, J. Math. Chem., 1991, 7, 155-168. ...
  • H. Wiener, J. American. Chem. Soc., 1947, 69, 17-20. ...
  • A.T. Balaban, J. Chem. Inf. Comput. Sci., 1985, 25, 334-343. ...
  • A.R. Nizami, T. Farman, J. Appl. Comput. Math., 2018, 7, ...
  • F. Shafiei, Iranian J. Math. Chem., 2015, 6, 15-28. ...
  • D. Bonchev, J. Chem. Inf. Comput. Sci., 2000, 40, 934-941. ...
  • S. Liu, H. Liu, Z. Xia, C. Cao, Z. Li, ...
  • O. Ivanciuc, T. Ivanciuc, D.J. Klein, W.A. Seitz, A.T. Balaban, ...
  • A. Alaghebandi, F. Shafiei, Iranian J. Math. Chem., 2016, 7, ...
  • Elizabeth R. Collantes, and William J. Dunn III, J. Med. Chem., 1995, 38, 2705-2713. ...
  • R.  Beigzadeh, J. Chem. Method., 2019, 3, 67-82. ...
  • Li. Yang, Mao. Shu, Kaiwang. Ma, Hu. Mei, Yongjun. Jiang, ...
  • S. Sahoo, M. Kuanar, S. Patel, B.K. Mishra, Indian. J. ...
  • A. Kidera, Y. konishi, M. Oka, T. Ooi, H. Scheraga, ...
  • Web search engine developed by ChemAxon; software available at http:// ...
  • M. Randić, Acta. Chim. Slov., 2002, 49, 483–496. ...
  • B. Zhou, I. Gutman, Chem. Phys. Lett., 2004, 394, 93-95. ...
  • D.J. Klein, W. Yan, Y.N. Yeh, INT. J. QUANTUM. CHEM., ...
  • M. Liu, B. Liu, MATCH Commun. Math. Comput. Chem., 2011, ...
  • M. Randić, X. Guo, T. Oxley, H. Krishnapriyan, J. Chem. ...
  • A.T. Balaban, Chem. Phys. Lett., 1982, 89, 399-404. ...
  • K.C. Das, B. Zhou, N. Trinajstić, J. Math. Chem., 2009, ...
  • I. Gutman, S. Klavžar, J.Chem. Inf. Comput. Sci., 1995, 35, ...
  • P.V. Khadikar, N.V. Deshpande, P.P. Kale, A. Dobrynin, I. Gutman, ...
  • نمایش کامل مراجع